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  • 【期刊】 湘鄂不同区域堇叶碎米荠居群间RAPD分析

    刊名:湖北农业科学 作者:向极钎 ; 王晓辉 ; 殷红清 ; 万海英 ; 李亚杰 ; 杨永康 ; 丛欣 关键词:RAPD ; 堇叶碎米荠(Cardamine violifolia O. E. Schulz) ; 遗传多样性 机构:恩施州农业科学院 ; 恩施州农业科学院 ; 湖北省富硒产业技术研究院 ; 湖北省农业科技创新中心鄂西综合试验站 ; 德源健康产业研究院 年份:2018
    摘要:采用RAPD分子标记技术对湘鄂5个不同区域的堇叶碎米荠(Cardamine violifolia O. E. Schulz)进行居群间遗传多样性分析,从50个随机引物中筛选出10个条带清晰、多态性明显且重复性好的引物,共扩增出78条DNA片段,其中49条为多态性条带,多态率达62.8%。利用NTSYS 2.10软件进行聚类分析,以相似系数0.68为标准,可将所有居群分为3类,第Ⅰ类为自选品种鄂碎米荠1号和恩施双河鱼塘坝居群;第Ⅱ类为宜昌长阳四方洞居群和湖南常德石门壶瓶山居群;宜昌五峰栗子坪居群独立分为一类。
  • 【期刊】 基于RAPD的白色金针菇菌株遗传多样性分析

    刊名:江西农业学报 作者:杨和川 ; 谭一罗 ; 苏文英 ; 秦裕营 ; 马腾 ; 浦汉春 ; 周振玲 关键词:RAPD ; 金针菇 ; 遗传多样性 ; 主成分分析 机构:连云港市农业科学院 ; 连云港市农业科学院 年份:2019
    摘要:利用RAPD技术研究了15株白色金针菇菌株的遗传多样性。试验从20条RAPD引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性丰富的引物,共扩增出45条片段,多态性比率为73.3%;供试金针菇菌株遗传相似系数在0.560~0.984之间,在0.68水平上供试菌株被聚为1个类群,在0.83水平上可分为4个类群。RAPD分析结果与主成分分析结果具有一致性,说明供试菌株间遗传多样性丰富,RAPD技术能够作为快速鉴别金针菇菌株亲缘关系的一种方法。
  • 【期刊】 内生真菌与大花红景天互作的RAPD标记分析

    刊名:微生物学杂志 作者:崔晋龙 ; 任晓琳 ; 王梦亮 关键词:RAPD ; 红景天 ; 内生真菌 ; 遗传性状 ; 聚类分析 机构:山西大学应用化学研究所 ; 山西大学应用化学研究所 年份:2017
    摘要:首次采用RAPD分子标记法研究内生真菌接种宿主红景天条件下,前者对后者DNA序列水平遗传性状的影响。结果显示,12条RAPD引物对ZPRs-R-11接种的红景天扩增出87条条带,多态性百分比为83.91%。聚类分析结果表明,内生真菌ZPRs-R-11接种的红景天可分为三个遗传分支,共培养时间越长,组培苗与内生真菌之间的遗传相似系数越大;红景天接种后,其基因流Nm为0.209 8。研究结果为内生真菌与宿主大花红景天共生条件下内生真菌对大花红景天的品质改良和研究提供参考。
  • 【期刊】 引种粗皮桉种源遗传多样性的RAPD与SSR分析

    刊名:西北林学院学报 作者:邓紫宇[1] ; 项东云[1] ; 熊涛[2] ; 李昌荣[1] ; 陈升侃[3] ; 梁机[3] ; 蓝必布[4] ; 兰俊[2] 关键词:粗皮桉 遗传多样性 RAPD SSR 机构:广西优良用材林资源培育重点实验室/广西林科院 ; 广西优良用材林资源培育重点实验室/广西林科院 年份:2017
    摘要:利用RAPD和SSR分子标记对粗皮桉7个种源遗传多样性进行分析,10条RAPD引物共扩增出157个位点,其中多态位点145个,多态性百分率92.34%,遗传一致度范围0.906 1~0.971 4;21对SSR引物共检测到252个等位变异,平均等位基因数为12个,平均有效等位基因数为4.6个,遗传一致度范围0.727 1~0.908 0。2种标记遗传一致度相关分析表明呈显著相关,说明2种标记分析粗皮桉遗传多样性具有较高一致性。聚类分析显示,RAPD标记将粗皮桉7个种源被划分为4个类群,SSR标记将粗皮桉7个种源被划分为3个类群,SSR标记聚类结果与粗皮桉种源地理分布密切相关。RAPD和SSR分子标记均适合粗皮桉遗传多样性分析,SSR标记更具可靠性。
  • 【论文】 安徽三个湖羊场种群遗传结构的RAPD分析

    作者:高茜 关键词:安徽湖羊 ; 遗传距离 ; 多样性指数 ; RAPD技术 机构:安徽农业大学 ; 安徽农业大学 年份:2018
    摘要:为了了解湖羊三个不同种群之间的遗传结构并开展接下来的保种工作,本文利用RAPD分子标记技术,对安徽省的三个湖羊种群进行多样性检测,分析了群体间的遗传多样性以及群体内部的个体差异。根据已有文献进行参考,挑选出25个多态性强条带多的随机引物,实验过程中筛选出10个重复性好条带清晰的多态引物进行RAPD分析、对3个场共96头湖羊基因组DNA分别进行扩增,根据Shannon多样性指数计算群体遗传多样性,Nei氏公式计算品种间的遗传距离指数,挑选特异性强的片段进行测序,并进行BLAST分析。10个引物产生不同程度多态性标记,这10个引物共得到DNA扩增片段61条,各引物最少扩增出4条片段,最多8条,平均每个引物扩增出6条DNA片段,片段长度大小在500到2000 bp之间。整个群体的多态位点数共52个,占总位点数85.25%。其中周氏羊场内多态位点为47个,占77.05%;云兴羊场多态位点为44个,占72.13%;玉山羊场内多态位点数为47个,占77.05%。结论:(1)周氏羊场湖羊种群中Nei's基因多样性指数为0.2949,shannon信息指数为0.4340。云兴羊场湖羊种群中Nei's基因多样性指数为0.2941,shannon信息指数为0.4348。玉山羊场湖羊种群中Nei's基因多样性指数为0.2815,shannon信息指数为0.4135。以种群内两两个体间的多样性指数来比较,及遗传多样性的大小顺序为周氏羊场>云兴羊场>玉山羊场。(2)周氏羊场和云兴羊场两个种群间的遗传相似性指数为0.9832;遗传距离为0.0169,周氏羊场和玉山羊场两个种群间的遗传相似性指数为0.9631;遗传距离为0.0379,云兴羊场和玉山羊场两个种群间的遗传相似性指数为0.9658;遗传距离为0.0348。(3)三个种群的相似度有变异,其中周氏羊场和云兴羊场相似度更大。(4)试验所得片段序列与大角羊OVIS分离出的43u染色体1、3、8、12、17、23、24序列和西藏牦牛分离出的5、16、17、24号染色体相似度高。
  • 【期刊】 清香桂红色与绿色茎干株系的RAPD差异分析

    刊名:云南农业大学学报(自然科学) 作者:陈海云 ; 周筑 ; 白平 ; 李红 ; 永培伟 ; 吴涛 ; 张学星 关键词:RAPD ; 清香桂 ; 红色茎干 机构:云南省林业科学院 ; 云南省林业科学院 ; 云南山川园林有限公司 年份:2018
    摘要:【目的】分别以红色和绿色茎干的清香桂植株为材料,对其遗传物质进行分子水平上的差异检测。【方法】用混合DNA样品对200个10碱基随机引物进行筛选,然后用筛出的引物对红色和绿色茎干的清香桂单株DNA样品各14个进行RAPD-PCR扩增,对差异性条带进行回收测序和核苷酸序列分析。【结果】43个引物在28个样品中具有多态性,8个能在多数红色和绿色茎干植株中产生差异条带,其中3个引物(C06、M09和N10)可稳定地产生清晰的7个差异性条带,且条带C06-350在所有14个红茎植株类型中都出现而在14个绿茎植株中均缺失,其核苷酸序列长度为352~381 bp,在NCBI上未搜索到同源的核苷酸或氨基酸序列。【结论】红茎与绿茎清香桂植株之间发生了遗传变化,C06-350是与清香桂红茎特征紧密联系的1个标记。
  • 【期刊】 中国工厂化栽培杏鲍菇菌株的RAPD和ISSR分析

    刊名:食用菌 作者:马红 ; 朱秀娜 ; 刘小雪 ; 尹永刚 ; 郑雪平 关键词:RAPD ; 工厂化杏鲍菇 ; 菌株 ; ISSR ; 遗传多样性 年份:2015
    摘要:为了研究国内工厂化栽培的杏鲍菇菌株的遗传多样性,对筛选的34个杏鲍菇菌株进行RAPD(Randomly Amplifiled Polyrnorphic DNA)和ISSR(Inter-Stmple sequence Repeat)分析。从31个RAPD引物中选取了23个引物对34株杏鲍菇工厂化生产菌株进行PCR扩增,共扩增出266条稳定清晰的DNA条带;从32个ISSR引物中选取了23个引物对34株杏鲍菇工厂化生产菌株进行PCR扩增,共扩增出211条稳定清晰的DNA条带。根据扩增结果,对34个杏鲍菇菌株进行了RAPD标记、ISSR标记及二者相结合的聚类分析。3种方法的分析结果相近,可分别将34个供试菌株分为4~5大类。研究为国内工厂化杏鲍菇栽培菌株的筛选、育种和栽培奠定基础。
  • 【期刊】 正品和伪品大黄的RAPD指纹图谱鉴定研究

    刊名:临床医药文献电子杂志 作者:刘宝忠 关键词:正品 ; 伪品 ; RAPD指纹图谱 ; 鉴定 机构:大庆市中医医院 ; 大庆市中医医院 年份:2019
    摘要:目的分析采用RAPD方法对正品和伪品大黄进行鉴定。方法现随机选取100个引物进行鉴定与分析,按随机数字表法分成实验组50个和对照组50个。对RAPD反应的实验体系进行优化,对照组筛选50个引物,采用的筛选方法为个体筛选,实验组筛选了50个引物,采用的方法是BSA的筛选方法。结果实验组得到了5个带有正品大黄特征性条带的引物,对照组得到了3个带有正品大黄特征性条带的引物。经对比,实验组的效率明显高于对照组,两组之间差异存在,具有临床统计学意义(P<0.05)。结论两组的方法安全可靠、准确率高、鉴定速度快、重现性好,均能够达到在分子水平上鉴定正品和伪品大黄基原的目的。实验组采用的BSA的方法筛选引物的效率远远高于个体筛选引物的效率。
  • 【期刊】 电子束辐照对睡莲植株的诱变效应及RAPD分析

    刊名:世界科技研究与发展 作者:张启明 ; 周瑜 ; 李佳 ; 吉建斌 ; 李清清 ; 周云龙 ; 苏颖 ; 梁前进 关键词:RAPD ; 电子束辐射 ; 睡莲 ; 诱变效应 机构:北京师范大学生命科学学院抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室 ; 北京师范大学生命科学学院抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室 ; 廊坊市农林科学院花卉研究所 ; 北京师范大学射线束技术与材料改性教育部重点开放实验室 ; 北京师范大学核科学与技术学院 年份:2015
    摘要:为探讨电子束辐照对睡莲"科罗拉多"的诱变效应,对其植株进行了剂量为5 Gy、10 Gy、15 Gy、20 Gy、25Gy、30 Gy、50 Gy的辐照,剂量率为1 Gy/s。将辐照后的植株与对照组在相同条件下种植,连续3年观察其营养生长和花部变化;并对不同辐照剂量的睡莲叶和花瓣DNA进行RAPD分析。结果显示,当年(2011年)各辐照组的营养体均存活,营养生长状况与对照组基本一致,但生殖生长上花量有所减少。次年(2012年)在10 Gy与15Gy组中各有1株的1朵花的花色有变化。第三年(2013年)10Gy组的同一变异株中出现1朵花保持了上一年的花色变异,花瓣大致为一半粉色一半黄色。与阴性对照比,RAPD分析10Gy剂量诱变的变异株,显示叶片RADP谱带发生或消失或新出现的明显变化。结果表明,电子束辐照可剂量依赖性地引起睡莲花量减少、花色改变,并诱发DNA产生变异。研究结果对电子束辐照培育睡莲优良品种提供了一定的依据。
  • 【期刊】 RAPD法探究百草枯对HepG2细胞基因组稳定性的影响

    刊名:河南师范大学学报:自然科学版 作者:唐超智[1] ; 张玉玲[1] ; 刘庆荟[1] ; 张子喻[1] ; 王雅茹[1] 关键词:RAPD ; 百草枯 ; HEPG2细胞 ; 基因组稳定性 ; 引物 ; 扩增产物 机构:[1]河南师范大学生命科学学院 ; [1]河南师范大学生命科学学院 年份:2018
    摘要:目的:探讨百草枯(PQ)处理对HepG2细胞基因组稳定性的影响.方法:采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记技术,选取20种随机引物分析PQ处理24h对HepG2细胞基因组稳定性的影响.结果:引物5’-GGAAGTCGCC-3’、5’-ACGCGCATGT-3’和5’-GAATCGGCCA-3’的扩增产物在正常组与7.21、10.67、15.78、22.36和34.57mg/L的PQ处理组间有较明显差异.其中,引物5’-GGAAGTCGCC-3’的2种扩增产物(约2200和2600bp)在所有PQ处理组均缺失;引物5’-ACGCGCATGT-3’的2种扩增产物(约250和1200bp)在高于7.21mg/L的PQ处理组均发生缺失,1种扩增产物(约1500bp)在34.57mg/L的PQ处理组发生缺失,另有2种扩增产物(约400和550bp)在34.57mg/L的PQ处理组含量较低;引物5’-GAATCGGCCA-3’有2种扩增产物(约900和1900bp)在全部PQ处理组均缺失,另2种扩增产物(约530和560bp)新出现在各PQ处理组.结论PQ处理会破坏HepG2细胞基因组的完整性和稳定性.
  • 【期刊】 草履蚧不同寄主和地理种群遗传分化的RAPD分析

    刊名:生态学报 作者:刘军侠 ; 刘全超 ; 姜文虎 ; 宋晓英 ; 高宝嘉 关键词:RAPD ; 草履蚧 ; 寄主植物 ; 种群分化 机构:河北农业大学林学院 ; 河北农业大学林学院 ; 河北省林木种质资源与森林保护重点实验室 年份:2016
    摘要:应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对草履蚧保定、石家庄、邯郸16个不同寄主地理种群遗传多样性和种群分化进行研究,结果显示4个RAPD引物共扩增出41个多态性位点,多态位点比率为100%。遗传距离指数在0.701—0.4360,平均为0.2395。其中以邯郸枫杨和邯郸垂丝海棠为寄主的草履蚧种群遗传距离最小(0.0701);以石家庄紫叶李和邯郸木槿为寄主的种群遗传距离最大(0.4360)。遗传一致度系数在0.6466—0.9290。说明草履蚧不同种群遗传多样性丰富并存在遗传差异。聚类分析结果表明草履蚧种群遗传多样性同时受到寄主和地理因素的双重影响,且不同寄主草履蚧种群已产生明显的遗传分化。
  • 【期刊】 湘鄂地区三叶木通野生资源的RAPD亲缘关系分析

    刊名:湖北农业科学 作者:李红英 ; 王晓辉 ; 覃大吉 ; 向极钎 ; 杨永康 ; 陈菲菲 ; 万海英 ; 周敏 ; 朱麟 关键词:RAPD ; 三叶木通[Akebia trifoliata(Thunb.) Koidz.] ; 野生资源 ; 亲缘关系 机构:恩施土家族苗族自治州农业科学院 ; 恩施土家族苗族自治州农业科学院 ; 恩施市舞阳办事处农业技术中心 年份:2018
    摘要:采用RAPD分子标记技术对湘鄂地区6个不同区域的野生三叶木通[Akebia trifoliata(Thunb.) Koidz.]进行了遗传多样性研究。从50个随机引物中筛选出10个条带清晰、多态性明显并且重复性好的引物,共扩增出86条DNA片段,其中73条为多态性条带,占总扩增带数的84.9%。利用NTSYS软件进行聚类分析,以相似系数0.578为标准,可将所有品种分为3类,第Ⅰ大类包括恩施红庙(紫色型)和湖南古丈(麻色型);第Ⅱ类包括建始花坪、巴东茶店子和宣恩椒园;恩施太阳河的独立分为第Ⅲ类。
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