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  • 【期刊】 尼罗罗非鱼IgT重链的蛋白表达及表达分析

    刊名:华南师范大学学报(自然科学版) 作者:曹琦琦 ; 王玉红 ; 仲小芳 ; 陈常仪 ; 王安利 关键词:尼罗罗非鱼 ; 无乳链球菌 ; IgT ; 免疫组化 ; 粘膜免疫 机构:华南师范大学生命科学学院∥生态与环境科学广东普通高校重点实验室∥广东省水产健康安全养殖重点实验室 ; 华南师范大学生命科学学院∥生态与环境科学广东普通高校重点实验室∥广东省水产健康安全养殖重点实验室 年份:2018
    摘要:IgT(Immunoglobulin T)作为新型免疫球蛋白在粘膜免疫中具有重要作用.文中根据尼罗罗非鱼IgT基因序列构建原核表达载体获得IgT重组蛋白,相对分子量约75 k Da,并制备出效价较高的小鼠抗罗非鱼IgT的多克隆抗体.荧光定量PCR检测证明:健康尼罗罗非鱼中IgT在多种组织中都有表达,其中脾脏、皮肤、肠和鳃中表达量相对较高.无乳链球菌感染后,皮肤和头肾中IgT mRNA的相对表达量分别在12 h和4 d显著上调.免疫组化结果显示:IgT蛋白在头肾和皮肤中均有少量分布,在无乳链球菌刺激后,在皮肤中出现大量分布.以上结果表明:IgT在尼罗罗非鱼皮肤粘膜免疫中具有重要作用.
  • 【期刊】 灰毡毛忍冬LmPAL1基因的克隆及表达分析

    刊名:中草药 作者:陈勋 ; 刘畅宇 ; 陈娅 ; 龙雨青 ; 童巧珍 ; 刘湘丹 ; 周日宝 关键词:表达分析 ; 灰毡毛忍冬 ; 苯丙氨酸解氨酶(PAL) ; 基因克隆 ; 生物信息学 机构:湖南中医药大学药学院 ; 湖南中医药大学药学院 ; 湖南省中药饮片标准化及功能工程技术研究中心 年份:2019
    摘要:目的克隆灰毡毛忍冬苯丙氨酸解氨酶(LmPAL1)基因全长序列,并进行生物信息学和表达模式分析。方法提取灰毡毛忍冬花总RNA,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和RACE技术克隆LmPAL1基因的全长cDNA序列;运用相关软件对该基因序列进行生物信息学分析;利用qRT-PCR测定灰毡毛忍冬茎、叶和不同花期花中该基因的相对表达量。结果克隆的LmPAL1基因开放阅读框(ORF)长度为2 145 bp,编码714个氨基酸,生物信息学分析预测为亲水性蛋白,定位于叶绿体中,包含PAL shielding结构域(527~641 aa),并且含有PAL/HAL活性中心序列GTITASGDLVPLSYIAG(196~212aa),与其他LmPAL1具有较高的相似度;LmPAL1基因q RT-PCR结果显示,7个花期材料以金黄色开花期相对表达量较高;与茎、叶比,白色花蕾期花的相对表达量最高,叶的最低。结论成功克隆了LmPAL1基因,为进一步研究该基因的功能以及遗传改良灰毡毛忍冬品质奠定基础,同时为探究灰毡毛忍冬绿原酸生物合成和调节机制提供了依据。
  • 【期刊】 两种食用菌漆酶基因克隆及表达分析

    刊名:基因组学与应用生物学 作者:艾柳英 ; 柯萍萍 ; 赖春芬 ; 张杰 ; 陈文星 ; 单书凯 ; 刘佳丝 ; 胡开辉 ; 孙淑静 关键词:表达分析 ; 营养条件 ; 杏鲍菇 ; 松杉灵芝 ; 漆酶基因 机构:福建农林大学生命科学学院 ; 福建农林大学生命科学学院 年份:2017
    摘要:漆酶在食用菌生长过程中具有降解木质素、影响子实体形成等重要生理功能,而营养条件会显著影响酶的形成。本研究克隆了杏鲍菇和松杉灵芝部分漆酶基因,比较分析了不同营养条件对漆酶基因表达量及胞外酶活的影响。结果表明,两种食用菌漆酶基因序列差异较大,蛋白同源性低;杏鲍菇在高N低C、高无机盐、完全培养基中胞外漆酶酶活较高,而在转录水平基因表达量高低分别为低N、完全、高N低C培养基;加入有机碳如蔗渣在促进松杉灵芝漆酶基因的转录同时可提高胞外酶活,同时Cu2+可诱导漆酶的分泌,但无诱导漆酶转录作用。C、N比例的调整对2种食用菌漆酶基因的表达与胞外酶活影响具有明显差异,高氮源可促进菌株漆酶的分泌。该结果为进一步探讨漆酶基因调控机制及其生物学功能提供理论基础,同时为改变营养条件提高食用菌胞外漆酶酶活,加强食用菌胞外漆酶的应用提供理论依据。
  • 【期刊】 麻疯树雌雄花中MADS-BOX基因的表达分析

    刊名:广西植物 作者:廖望 ; 闫晓雪 ; 吴军 ; 陈放 关键词:麻疯树 ; MADS-BOX基因 ; 性别分化 ; 花发育 ; 实时荧光定量PCR 机构:四川大学生命科学学院 ; 四川大学生命科学学院 年份:2018
    摘要:麻疯树(Jatropha curcas)种子含油率高,种子中的油类物质可作为生物柴油被开发和利用,是极具潜力的生物质能源树种之一。麻疯树雌雄异花,在自然条件下雄花数量通常远远大于雌花,这大大限制了种子和油的产量,因此开展麻疯树性别分化与花发育分子机理的研究具有重要意义。该研究选取10个麻疯树的MADS-BOX基因(JcAGL1,JcAGL6,JcAGL9,JcAGL11,JcAGL15,JcAGL61-3,JcAGL62-1,JcAGL62-6,JcAGL62-7,JcAGL80-2),提取麻疯树早期发育各个阶段的雌雄花总RNA,并反转录成cDNA,采用实时荧光定量方法,探索早期发育不同阶段的麻疯树雌雄花目的基因的表达情况。结果表明:目的基因在发育起始的雌雄花中的表达具有差异,比如JcAGL6和JcAGL15在雄花中表达量要高于雌花,而JcAGL1,JcAGL9和JcAGL11在雌花中的表达量要高于雄花,这说明花原基中目的基因表达会直接或间接决定性别分化的方向;在之后的发育过程中,目的基因的表达情况在雌雄花中有所不同:随着花的发育,目的基因在雌雄花中的表达量变化存在差别,这反应出麻疯树雌雄花发育中目的基因表达模式上的差异;另外,也能看出在此过程中各个目的基因又发挥着不同的功能。该研究结果为进一步探究麻疯树雌雄花发育相关基因的表达提供了理论依据,为了解麻疯树性别分化和花发育的分子机理奠定了基础。
  • 【期刊】 麻疯树雌雄花中MADS-BOX基因的表达分析

    刊名:广西植物 作者:廖望 ; 闫晓雪 ; 吴军 ; 陈放 关键词:麻疯树 ; MADS?BOX基因 ; 性别分化 ; 花发育 ; 实时荧光定量PCR 机构:四川大学 ; 四川大学 ; 生命科学学院 年份:2018
    摘要:麻疯树(Jatropha curcas)种子含油率高,种子中的油类物质可作为生物柴油被开发和利用,是极具潜力的生物质能源树种之一.麻疯树雌雄异花,在自然条件下雄花数量通常远远大于雌花,这大大限制了种子和油的产量,因此开展麻疯树性别分化与花发育分子机理的研究具有重要意义.该研究选取10个麻疯树的MADS?BOX基因(JcAGL1,JcAGL6,JcAGL9,JcAGL11,JcAGL15,JcAGL61-3,JcAGL62-1,JcAGL62-6,JcA-GL62-7,JcAGL80-2),提取麻疯树早期发育各个阶段的雌雄花总RNA,并反转录成cDNA,采用实时荧光定量方法,探索早期发育不同阶段的麻疯树雌雄花目的基因的表达情况.结果表明:目的基因在发育起始的雌雄花中的表达具有差异,比如JcAGL6和JcAGL15在雄花中表达量要高于雌花,而JcAGL1,JcAGL9和JcAGL11在雌花中的表达量要高于雄花,这说明花原基中目的基因表达会直接或间接决定性别分化的方向;在之后的发育过程中,目的基因的表达情况在雌雄花中有所不同:随着花的发育,目的基因在雌雄花中的表达量变化存在差别,这反应出麻疯树雌雄花发育中目的基因表达模式上的差异;另外,也能看出在此过程中各个目的基因又发挥着不同的功能.该研究结果为进一步探究麻疯树雌雄花发育相关基因的表达提供了理论依据,为了解麻疯树性别分化和花发育的分子机理奠定了基础.
  • 【期刊】 盐胁迫下盐穗木HcThi1基因的表达分析

    刊名:基因组学与应用生物学 作者:杜驰 ; 张冀 ; 张富春 关键词:盐穗木 ; 盐胁迫 ; HcThi1基因 ; DNA损伤修复 ; 基因表达 机构:新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室 ; 新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室 年份:2016
    摘要:环境胁迫能够导致植物的DNA损伤,而DNA损伤修复基因与盐胁迫可能具有密切的相关性。根据盐穗木盐胁迫下响应的转录组测序结果,克隆获得了盐穗木具有DNA损伤修复功能的硫胺素噻唑合成酶(thiazole biosynthetic enzyme)基因,其开放阅读框1 077 bp,编码358个氨基酸,命名为HcThi1。保守结构域分析显示,保守结构域分析发现其具有SDR超家族保守结构域,合成硫胺素噻唑。系统进化树分析显示HcThi1为独立的分支,亚细胞定位于细胞质,为无信号肽的不稳定蛋白。实时荧光定量PCR分析表明,在100 mmol/L NaCl胁迫72 h后,同化枝中HcThi1的表达迅速上调并达到最大值,约为对照组的18.66倍,随着盐浓度的提高,HcThi1的表达逐渐降低。说明HcThi1基因表达受盐胁迫的诱导。研究结果有助于阐明HcThi1基因表达与植物抗盐的相关性。
  • 【期刊】 滨麦LmNHX2基因及响应盐分胁迫的表达分析

    刊名:鲁东大学学报:自然科学版 作者:李中虎[1] ; 李岚[2] ; 武海蒙[2] ; 朱路英[2] ; 柏新富[1] 关键词:表达分析 ; 滨麦 ; 液泡膜Na~+/H~+逆向转运蛋白2 ; 生物信息学分析 机构:[1]鲁东大学生命科学学院 ; [1]鲁东大学生命科学学院 ; [2]鲁东大学农学院 年份:2018
    摘要:液泡膜Na~+/H~+逆向转运蛋白(Na~+/H~+antiporter,NHX)基因是植物细胞中一类重要的耐盐基因.本研究在转录组测序的基础上,得到了滨麦液泡膜Na~+/H~+逆向转运蛋白2基因(LmNHX2)的cDNA序列,通过生物学软件对该基因编码的蛋白进行分析和预测,并对其响应盐胁迫的表达模式进行了分析.结果显示,LmNHX2的cDNA序列包含1617bp的开放阅读框,编码538个氨基酸.该基因编码的多肽链疏水性氨基酸占多数,具有典型的跨膜蛋白的结构特点.氨基酸序列比对结果表明,LmNHX2蛋白与小麦TaNHX2,长穗偃麦草Te NHX2及大麦Hv NHX1的氨基酸序列高度相似,四者在进化关系上居于同一分支.荧光定量PCR结果显示,LmNHX2的表达受到盐分胁迫的诱导.
  • 【期刊】 黑麦热激蛋白ScHsp90-1基因的克隆及表达分析

    刊名:山东农业科学 作者:王利彬 ; 董爽爽 ; 王灿国 ; 程敦公 ; 李豪圣 ; 刘爱峰 ; 宋健民 ; 刘建军 ; 刘成 ; 张玉梅 ; 穆平 ; 赵振东 ; 曹新有 关键词:表达分析 ; 黑麦 ; 热激蛋白Hsp90 ; 克隆 机构:[1]青岛农业大学农学院 ; [1]青岛农业大学农学院 年份:2018
    摘要:本研究从黑麦中克隆了一个热激蛋白Hsp90基因,暂命名为ScHsp90-1,并对其序列进行分析。结果显示,该基因cDNA序列全长2 103 bp,共计编码700个氨基酸,蛋白质分子量约80.47 k D。序列同源性分析表明,ScHsp90-1与小麦、玉米、水稻等物种的热激蛋白同源性较高;进化树分析表明ScHsp90-1与小麦的Ta Hsp90亲缘关系最近。利用实时荧光定量PCR技术对其表达特性分析表明,ScHsp90-1对高温、低温、高盐、干旱等非生物胁迫均有响应,其可能是黑麦的一个胁迫相关基因。
  • 【期刊】 茶树水通道蛋白基因的克隆与表达分析

    刊名:西北植物学报 作者:岳川 ; 曹红利 ; 王赞 ; 陈丹 ; 林宏政 ; 孙云 ; 叶乃兴 关键词:表达分析 ; 茶树 ; 水通道蛋白基因 ; 非生物胁迫 机构:福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室 ; 福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室 年份:2018
    摘要:从茶树中克隆了6个水通道蛋白(aquaporin,AQP)基因的cDNA全长序列,根据序列相似性和系统进化分析结果,分别命名为CsNIP1;1、CsNIP5;1、CsPIP2;1、CsPIP2;2、CsTIP1;1和CsTIP2;2。氨基酸序列特征分析表明,6个基因的编码氨基酸序列长度在250~301个氨基酸残基,分子量在25.186~30.728kD之间;均为疏水性蛋白,并都含有6个跨膜螺旋;6个基因均含有MIP蛋白家族的特征序列HF/I/VNPA/SI/L/VTI/FA/G和NPA(Asn-Pro-Ala)基序,以及类似沙漏状的跨膜三级结构。荧光定量PCR分析显示:这6个基因在根、茎、叶和花中均表达,且在根中的表达水平最高,表明它们与茶树根系的物质转运密切相关;CsAQPs基因的表达受ABA、高盐、干旱和低温胁迫的调控,表明它们可能参与茶树抗逆响应。
  • 【期刊】 中华蜜蜂酪胺受体基因克隆及表达分析

    刊名:遗传 作者:张丽珍 ; 张永 ; 胡景华 ; 王子龙 ; 曾志将 关键词:表达分析 ; 中华蜜蜂 ; 酪胺受体基因 ; 分子克隆 机构:江西农业大学蜜蜂研究所 ; 江西农业大学蜜蜂研究所 年份:2018
    摘要:酪胺(tyramine)属于生物多聚胺类,是昆虫中枢神经系统内重要的神经递质、神经调质和神经激素,参与调控昆虫的多种行为和生理过程,如酪胺受体基因参与调控动物的学习与记忆。本研究首次克隆获得中华蜜蜂(Apis cerana cerana)酪胺受体基因Actyr1和Actyr2的全长c DNA序列,利用q RT-PCR方法鉴定了Actyr1和Actyr2在中华蜜蜂不同组织器官中的表达谱,采用地高辛原位杂交技术对Actyr1和Actyr2在大脑中的表达进行了定位。中华蜜蜂Actyr1、Actyr2的c DNA全长序列分别为1241 bp(Gen Bank登录号:KC814693)和1270 bp(Gen Bank登录号:KC814694),分别编码297、399个氨基酸残基。q RT-PCR分析结果表明,Actyr1和Actyr2在不同组织中的表达量为头部最高,其次是腹部表皮,触角和胸部肌肉的表达量最低,并且头部的表达量显著高于其他组织的表达量;原位杂交结果显示,Acytr1和Actyr2在中华蜜蜂大脑蘑菇体的凯尼恩细胞、触角叶周围的细胞处均有较强阳性着色。这些研究表明,Acytr1和Actyr2基因可能参与了蜜蜂的学习记忆,并且在相同的细胞中互相作用,共同调控蜜蜂的生物学功能。
  • 【期刊】 黄瓜耐镉相关基因CsNAC019的克隆及表达分析

    刊名:中国农业科学 作者:李慧园 ; 田春育 ; 郑玉莹 ; 武涛 关键词:表达分析 ; 黄瓜 ; 基因克隆 年份:2017
    摘要:[目的]研究黄瓜耐镉(Cd)分子机制,结合生物信息学分析获得一个NAC转录因子家族基因CsNAC019,对其进行克隆和表达分析,为进一步将该基因用于黄瓜耐Cd品种的改良与选育提供试验基础.[方法]通过PCR技术扩增CsNAC019全长;利用NCBI和DNAMAN进行序列比对和保守结构域分析;利用Expasy、TMHMM等在线软件进行氨基酸组成、稳定系数、亲水系数分析;通过PlantCARE在线工具进行启动子序列分析;采用MEGA 6.0软件根据NJ方法,构建系统进化树;采用qRT-PCR技术检测Cd胁迫后黄瓜CsNAC019在叶中的表达情况,并用DPS 7.05数据处理系统软件进行方差及显著性分析.[结果]CsNAC019含有典型的NAC保守结构域.通过BLAST分析比对,该基因在氨基酸序列上与拟南芥NAC019存在60%的同源性,两者在从N端到C端有A、B、C、D、E5个氨基酸相对保守区的序列高度一致.该基因CDS序列全长为960 bp,编码31 9个氨基酸,编码蛋白质分子量为35.66 kD,理论等电点为8.72,不稳定系数为68.18,平均亲水系数为-0.483.启动子分析表明,除含有真核生物启动子固有的TATA和CAAT元件外,CsNAC019的启动子序列还存在G-box、ABRE、W-box、P-box、TCA-element、TC-richrepeats、HSE等多种响应逆境胁迫的顺式元件.系统进化分析表明,CsNAC019与甜瓜、桃、苹果、柑桔、葡萄、大豆等1 5种植物NAC转录因子有64%-96%的同源性,其中与甜瓜的NAC蛋白同源性最高,为96%.通过qRT-PCR分析发现,与对照相比,CsNAC019在Cd胁迫条件下表达量明显上调(8.2倍).[结论]CsNAC019为黄瓜Cd胁迫诱导表达基因,推测其可能通过调节下游基因的表达调控黄瓜对Cd胁迫的应答.
  • 【期刊】 黄瓜耐铜相关基因CsLecRK的克隆及表达分析

    刊名:北方园艺 作者:赵金凤[1,2] ; 田春育[1,2] ; 郭冬雪[1,2] ; 武涛[1,2] 关键词:表达分析 ; 黄瓜 ; 耐铜基因 ; CsLecRK 机构:东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 ; 东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 ; 东北农业大学园艺园林学院 年份:2017
    摘要:以黄瓜为试材,根据基因响应铜(Cu)的表达模式及保守性,采用基因克隆和生物信息学方法,对筛选获得的黄瓜凝集素受体激酶基因(CsLecRK)进行克隆及生物信息学分析,并对该基因在Cu胁迫条件的表达模式进行分析,以期探索黄瓜耐铜(Cu)的分子机制。结果表明:该基因cDNA全长为2 121 bp,编码706个氨基酸;理论分子量为78.36kDa,等电点为7.76。NCBI Blastp分析与进化树分析均表明,CsLecRK编码的蛋白与甜瓜的LecRK序列同源性最高(95%),进化距离最近。qRT-PCR分析表明,CsLecRK在Cu胁迫条件下表达明显下调。
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