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  • 【期刊】 暗光环境对木薯叶片蛋白质组的影响

    刊名:植物生理学报 作者:吕亚 ; 安飞飞 ; 李开绵 ; 陈松笔 关键词:蛋白质组 ; 木薯 ; 叶片 ; 暗光环境 ; 叶绿素含量 机构:云南省热带作物科学研究所 ; 云南省热带作物科学研究所 年份:2017
    摘要:以木薯(Manihot esculenta)栽培种‘华南5号’(SC5)为研究材料,利用双层黑塑料袋造成暗光环境,木薯在暗光环境分别生长0、1、3、9 d和暗光环境9 d后见光4 h,采用蛋白质组学方法,揭示与光合作用相关的蛋白质表达水平变化。结果表明:随着暗光环境处理天数的增加,叶绿素总含量整体呈下降趋势;以0 d暗光环境处理的木薯叶片蛋白质图谱为对照,通过其他暗光环境处理共得到45个平均差异表达量为对照±2.0倍以上的蛋白质,它们的生物学功能涉及光合作用、碳和能量代谢、结构、解毒、抗氧化等。而ATP合酶、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(RuBisCO)活化酶、RuBisCO大亚基、磷酸核酮糖激酶前体、光系统I亚基及RuBisCO小亚基前体随着暗光环境处理天数延长而下调,显示这些蛋白质的表达水平与光合作用强弱密切相关。
  • 【期刊】 人HEK293T细胞外泌体的蛋白质组学分析

    刊名:继续医学教育 作者:殷爱红 ; 胡家 ; 任晓曦 ; 杨颖 关键词:外泌体 ; 超速离心 ; FASP酶解 ; LC/MS/MS 机构:首都医科大学中心实验室 ; 首都医科大学中心实验室 ; 首都医科大学基础医学院 年份:2018
    摘要:目的建立一套完整的外泌体样品提取,液质联用蛋白质组学检测方法。方法采用超速离心法提取细胞培养液外泌体,经过FASP酶切,收集酶解肽段,通过Easy-Nano LC液相色谱仪和Triple TOF6600质谱仪(美国Sciex公司)液质联用检测外泌体全酶解产物,并通过ProteinPilot软件(Sciex)处理数据,检索Uniprot的相应数据库,从而鉴定外泌体蛋白质。结果通过超速离心法,成功提取到细胞培养液外泌体。并通过LC-MS-MS方法,软件分析和数据库检索到833个匹配蛋白。结论此方法可有效获取外泌体,并鉴定外泌体蛋白质。
  • 【期刊】 细粒棘球绦虫蛋白质组学研究进展

    刊名:畜牧兽医学报 作者:徐梦飞 ; 卢平萍 ; 马勋 ; 张艳艳 ; 王炜烨 ; 孟季蒙 ; 王正荣 ; 薄新文 关键词:细粒棘球绦虫 ; 原头蚴 ; 蛋白质组学 ; 包虫病 机构:[2]石河子大学动物科技学院 ; [2]石河子大学动物科技学院 年份:2018
    摘要:随着人类基因组计划(Human genomic project,HGP)的实施和推进,生命科学研究已进入后基因组时代,而蛋白质组学是后基因组时代生命科学研究的热门之一。包虫病作为一种重要的人兽共患病,给人类带来了巨大的健康威胁和经济损失,因此,包虫病的预防、诊断和治疗是人们迫切需要研究的课题,本文就近几年细粒棘球绦虫蛋白质组学研究的进展进行叙述,并对相关的研究方法和手段作出科学的论述,旨在阐述细粒棘球绦虫与宿主在分子水平的相互作用方式,为包虫病的疫苗研发、诊断标志物和诊断药物靶点的筛选提供参考。
  • 【期刊】 MALDI-TOF-MS对DAI大鼠脑干蛋白质组学的分析

    刊名:法医学杂志 作者:任冠恒 ; 刘宁国 ; 陈忆九 ; 施妍 ; 邹冬华 ; 黄平 ; 李正东 ; 邵煜 ; 邓恺飞 关键词:法医病理学 ; 弥漫性轴索损伤 ; 质谱分析法 ; 基质辅助激光解吸电离 ; 脑干 ; 大鼠 机构:南方医科大学基础医学院法医学系 ; 南方医科大学基础医学院法医学系 ; 司法部司法鉴定科学技术研究所上海市法医学重点实验室 年份:2016
    摘要:目的应用基质辅助激光解吸/电离-飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization timeof-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术建立弥漫性轴索损伤(diffuse axonal injury,DAI)诊断模型,筛选DAI相关蛋白或多肽,为寻找DAI的分子标志物提供理论基础。方法将15只雄性SD大鼠随机分为DAI组(n=10)和对照组(n=5),采用MALDI-TOF-MS技术对两组大鼠脑干组织的蛋白或多肽表达谱进行检测,运用Clin Pro Tools 2.2分析软件筛选出具有差异的分子峰,应用遗传算法建立诊断模型。结果筛选出有差异的分子峰61个(P<0.05),其中DAI组有9个分子峰下调,52个分子峰上调。筛选出5个分子峰建立诊断模型,交叉验证的特异性为96.14%、敏感性为95.98%,盲法验证结果的特异性为73.33%、敏感性为70.00%。结论应用MALDI-TOF-MS技术不仅能够建立特异性和敏感性较高的DAI诊断模型,还可以筛选差异蛋白或多肽,为DAI的法医学鉴定奠定理论基础。
  • 【期刊】 基于蛋白质组学分析跳枝梅花色差异

    刊名:北京林业大学学报 作者:吴欣欣 ; 倪晓鹏 ; 周泳 ; 宫庆华 ; 高志红 关键词:蛋白质组 ; 梅花 ; 花色 ; 差异蛋白 ; RT-PCR 机构:南京农业大学园艺学院 ; 南京农业大学园艺学院 ; 中山陵管理局 年份:2015
    摘要:本研究采用TCA/丙酮法提取‘复瓣跳枝’梅白色和红色花蕾的总蛋白进行2-DE和MALDI-TOF/TOF MS分析,初步研究其跳色的分子机理。结果显示:红花和白花相比有21个蛋白质点的相对丰度变化大于2倍,7个上调,14个下调。通过数据库鉴定出其中20个蛋白质,根据其功能分为:能量与代谢、转录、细胞结构、信号途径、次生代谢、蛋白合成、细胞生长以及防御。其中,核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶、无机焦磷酸酶等在红花中为上调蛋白,可能为植物色素的合成运输提供能量。我们进一步采用qRT-PCR方法对编码12个差异蛋白的基因在转录水平进行了分析;同时对过氧化物酶蛋白的酶活性检测,结果显示在红花中该酶活性显著高于白花,这与蛋白趋势一致。基于蛋白质组分析,我们推测与信号转导相关的生长素结合蛋白和茉莉酸甲酯合成的关键酶丙二烯氧化物环化酶可能是造成跳枝梅花色变化的关键环节。
  • 【期刊】 蛋白质组学应用于中医虚证研究进展

    刊名:山东中医药大学学报 作者:雒岁芳 ; 宋小莉 ; 庞小刚 ; 刘慧敏 关键词:蛋白质组学 ; 虚证 ; 本质 ; 诊断 ; 综述 机构:山东中医药大学 ; 山东中医药大学 年份:2017
    摘要:蛋白质组学是后基因组时代系统生物学的一部分。从分子生物学角度研究机体在蛋白质水平上的定量、动态及整体性,同中医证候的"整体观""动态观"特征具有一致性。概述了蛋白质组学技术应用于中医气虚证、血虚证、阴虚证、阳虚证的研究,分析各证候蛋白质差异性表达,探寻了相应的生物标志物,以期为疾病证候诊断提供客观指标,阐明中医虚证的本质。参考文献32篇。
  • 【期刊】 肺腺癌患者尿蛋白质组差异表达分析

    刊名:武警后勤学院学报(医学版) 作者:张民 ; 陈振岗 ; 张文成 ; 史学军 ; 谢辉 ; 陈欢 ; 王广舜 关键词:肺腺癌 ; 尿蛋白质组 ; 纤维蛋白酶原 ; 纤维蛋白原γ 机构:天津医科大学宝坻临床学院 ; 天津医科大学宝坻临床学院 ; 天津医科大学宝坻临床学院肿瘤外科 ; 天津医科大学宝坻临床学院胸外科 ; 西南医科大学临床医学系 年份:2019
    摘要:【目的】探讨肺腺癌患者和健康志愿者尿蛋白质差异表达谱,寻找具有诊断价值的生物标志物。【方法】选取肺腺癌患者的尿标本13例,以22例健康志愿者尿标本作为对照组,利用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)技术和MS-Thermo-Orbitrap-Velos质谱对肺腺癌患者和健康志愿者尿进行蛋白质组学比较。采用酶联免疫吸附剂测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)验证质谱结果。应用受试者工作曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)评估差异蛋白的临床价值。【结果】表达谱共鉴定出365个差异表达蛋白质,表达上调蛋白质185个、表达下调蛋白质180个,筛选出凝血与免疫通路相关蛋白质10个,ROC分析发现纤维蛋白溶酶原(plasminogen,PLG)和纤维蛋白原γ(Fibrinogen gamma chain,FGG)的敏感性和特异性均>80%,且曲线下面积(area under curve,AUC)>0.8。ELISA法实验结果与质谱结果趋势一致,FGG、PLG作为联合检测项目鉴别肺腺癌与健康人群的AUC为0.947,相对单一检测项目FGG(0.844)和PLG(0.934)的诊断效能更高(P<0.05)。但是,肺腺癌患者尿中FGG、PLG表达水平与患者的年龄、性别、吸烟、临床分期均无关。【结论】尿中FGG与PLG可以作为辅助肺腺癌诊断的标志物,但其与肺腺癌的各项临床参数之间无明显联系,需要进一步扩大样本进行分析。
  • 【期刊】 铜绿假单胞菌SJTD-1的磷酸化蛋白质组

    刊名:上海交通大学学报 作者:邢雪娇;李文婷;侯敬丽;刘建华; 关键词:铜绿假单胞菌;;磷酸化蛋白;;液相色谱质谱 机构:上海交通大学药学院 ; 上海交通大学药学院 ; 上海交通大学生命科学与技术学院 ; 上海交通大学分析测试中心 年份:2017
    摘要:制备了铜绿假单胞菌SJTD-1菌株的蛋白质组酶解产物,并利用二氧化钛磁珠从酶解产物中富集磷酸化肽.首次利用纳升液相色谱-质谱技术鉴定磷酸化肽的磷酸化位点,最终共鉴定获得13条磷酸化肽,分别来自12个磷酸化蛋白,其中有7个磷酸化蛋白在假单胞菌中是首次发现.分析鉴定到的磷酸化蛋白,发现大多与DNA复制、物质转运、能量代谢等密切相关.这是首次对铜绿假单胞菌SJTD-1菌株进行磷酸化蛋白质组学分析,为SJTD-1在DNA复制、物质和能量代谢以及细胞膜转运等方面的研究奠定基础.
  • 【期刊】 SDS-PAGE法分析不同加工方法对鸡蛋蛋白质组成的影响

    刊名:长江大学学报(自科版) 作者:曹金虎 ; 王令冉 ; 罗静波 ; 俞海东 ; 韩荣勋 关键词:鸡蛋 ; 加工方法 ; 蛋白质 ; SDS-PAGE 机构:长江大学动物科学学院 ; 长江大学动物科学学院 年份:2018
    摘要:采用SDS-PAGE法比较了生鲜鸡蛋、煮鸡蛋、茶叶蛋、咸鸡蛋、盐焗鸡蛋、卤鸡蛋中的主要蛋白质的组成,结果表明:在8%和12%分离胶中生鲜鸡蛋均存在多种分子量不同的蛋白质。在8%分离胶中煮鸡蛋和茶叶蛋中大分子量蛋白质基本消失,只在85~40ku范围内存在蛋白质条带,而在咸鸡蛋、盐焗鸡蛋、卤鸡蛋中只在85~50ku范围内存在蛋白质条带。同样,在12%分离胶中煮鸡蛋和茶叶蛋中大分子量蛋白质基本消失,只在85~40ku范围内存在蛋白质条带,然而在20ku以下能观察到1条明显的蛋白质条带。在12%分离胶中,咸鸡蛋、盐焗鸡蛋、卤鸡蛋在20ku以下也能观察到1条明显的蛋白质条带。
  • 【期刊】 肝细胞癌转移相关蛋白的iTRAQ定量蛋白质组学研究

    刊名:基因组学与应用生物学 作者:谢玲林 关键词:蛋白质组 ; 肝细胞癌 ; 转移 ; iTRAQ 机构:四川护理职业学院 ; 四川护理职业学院 年份:2017
    摘要:为了寻找与肝细胞癌转移相关的蛋白,本研究选择了具有相同遗传背景但不同转移能力的两个肝癌细胞系MHCC97H和HCCLM6,在采用超滤辅助样品制备(filter aided proteome preparation,FASP)方法和相对和绝对定量同位素标记(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)技术对样品进行处理后,对所提取的蛋白质进行了质谱鉴定和定量分析,对差异蛋白进行了包括亚细胞定位,生物学过程和分子功能富集在内的生物信息学分析。我们共鉴定了4 987个蛋白,与MHCC97H细胞系相比HCCLM6中有93个差异表达蛋白(|ratio|≥1.5,一个样本t检验,p<0.05),其中40个蛋白上调,53个蛋白下调,且大多数差异表达的蛋白质位于细胞质和细胞膜。GO分析表明与细胞粘附和蛋白质结合相关的蛋白质在差异蛋白中显著富集。本研究为肝癌转移机制的进一步研究提供了一定的帮助。
  • 【期刊】 利用肽配体库分析蛋清中低丰度蛋白质组

    刊名:分析测试学报 作者:刘怡君 ; 邱宁 ; 马美湖 关键词:鸡蛋清 ; 肽配体库 ; 低丰度蛋白质 ; 线性离子阱 机构:国家蛋品加工技术研发分中心华中农业大学食品科技学院 ; 国家蛋品加工技术研发分中心华中农业大学食品科技学院 ; 大连市食品检验所大连市食品药品监督管理局 年份:2015
    摘要:利用肽配体库技术(CPLL)研究了蛋清中的低丰度蛋白质组。考察了盐浓度和洗脱顺序差异对CPLL富集效率的影响。结果表明:盐浓度越高,蛋清蛋白质溶液的离子相互作用越强。利用洗脱溶液解离差异,采用先HOS(有机水溶液)后尿素CHAPS(3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]-1-丙磺酸内盐)的洗脱顺序,溶菌酶能够得到高效分离。保持蛋清的原p H 8.8,25 mmol/L KH2PO4,150 mmol/L Na Cl,尿素CHAPS洗脱,是CPLL提供高效富集的前提。通过分析CPLL富集前后的十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)条带差异,采用线性离子阱(LTQ)质谱在蛋清中检出45种低丰度蛋白质,其中两种未见报道。对蛋清中低丰度蛋白质亚细胞的定位分析发现,蛋清蛋白质的分泌蛋白居多。研究结果表明,CPLL技术能够实现蛋清中低丰度蛋白质的高效富集,分析深度达到亚细胞水平。
  • 【期刊】 C-反应蛋白损伤内皮细胞的蛋白质组学研究

    刊名:中国医学创新 作者:刘少军 ; 胡坤华 ; 刘慰华 关键词:内皮细胞 ; 蛋白质组学研究 ; 动脉粥样硬化 机构:广州医科大学附属第二医院 ; 广州医科大学附属第二医院 ; 中山大学中山医学院 年份:2017
    摘要:目的:从蛋白质组学的角度探讨C-反应蛋白(CRP)损伤内皮细胞(EC)的作用机制.方法:采用培养的人冠状动脉内皮细胞HCAEC第4代用于实验,25μg/mL CRP刺激HCAEC 24 h,2D DIGE结合MALDI-ToF-ToF质谱鉴定进行蛋白质组学分析研究.结果:发现差异表达蛋白斑点11个,鉴定出其中4个,包括Heat shock cognate 71 kDa protein、Elongation factor 1-beta和Proteasome activator complex subunit 1等.结论:通过蛋白质组学研究,筛选了CRP损伤EC的差异表达蛋白,为深入理解EC损伤的分子机制提供有益的线索.
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