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  • 【期刊】 第一个蛋白-蛋白相互作用抑制剂venetoclax

    刊名:药学学报 作者:郭宗儒 关键词:蛋白-蛋白相互作用 ; 激酶抑制剂 ; 蛋白酶抑制剂 ; 干扰蛋白 ; 批准上市 ; 结构特征 ; 小分子 机构:中国医学科学院、北京协和医学院药物研究所 ; 中国医学科学院、北京协和医学院药物研究所 年份:2018
    摘要:1引言 干扰蛋白一蛋白相互作用的小分子,批准上市的第一个药物是venetoclax。一些蛋白酶抑制剂或激酶抑制剂虽然也是干预蛋白与蛋白的作用,但由于反应位点有特定的结构特征、特异的结合腔,或辅酶的参与,
  • 【期刊】 牛支原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建

    刊名:动物医学进展 作者:刘威 ; 袁芳艳 ; 周丹娜 ; 刘泽文 ; 杨克礼 ; 段正赢 ; 郭锐 ; 肖少波 ; 田永祥 关键词:蛋白相互作用 ; 牛支原体 ; 互作网络 机构:华中农业大学农业微生物学国家重点实验室 ; 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室 年份:2015
    摘要:病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了牛支原体的蛋白-蛋白相互作用网络,所构建的互作网络包含138个蛋白和693个相互作用关系。通过蛋白的互作频率分析,确定了在牛支原体中互作频率最高的20个蛋白,这些蛋白主要与转录、翻译、分子伴侣等功能相关。进一步分析发现,伴侣蛋白DnaK和ClpB发生互作的频率较高,能与核糖体蛋白、代谢相关蛋白等多种功能蛋白发生相互作用。结果提示,若DnaK和ClpB的功能受到抑制,将会对牛支原体的正常生命活动造成较大的影响。
  • 【期刊】 CDC25B与CDK2/Cyclin A蛋白相互作用研究

    刊名:天津医科大学学报 作者:陈秀博 ; 晋文燕 ; 吴晓辉 ; 马英 关键词:CDC25B ; CDK2/Cyclin ; A ; 蛋白-蛋白对接 ; 关键氨基酸 机构:天津医科大学药学院 ; 天津医科大学药学院 ; 天津市临床药物关键技术重点实验室 年份:2018
    摘要:目的:研究双特异性蛋白磷酸酶B(CDC25B)与细胞周期素A(Cyclin A)和细胞周期素依赖性激酶2(CDK2)蛋白发生相互作用的结构基础。方法:应用Discovery Studio(DS)v3.5中的ZDOCK模块对CDC25B与CDK2/Cyclin A蛋白进行对接。应用“Analyze Protein Interface”模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白的溶剂可及表面积(SAS)并分析CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面的关键氨基酸残基。应用“Calculate Interaction Energy”模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面处的关键氨基酸残基间的相互作用能。结果:对pose 1的疏水相互作用、氢键相互作用、相互作用能进行计算分析,预测得到CDC25B-CDK2/Cyclin A复合物的结合模式及起相互作用的氨基酸残基(CDC25B:GLY380,TYR382,ARG485,ARG488,GLU489,ARG490,ARG492,TYR497;CDK2/Cyclin A:THR165,TRP167,ASP206,SER207,ASP210,PHE213)。结论:该结果为今后深入研究CDC25B通路和发挥协同刺激作用的信号体系以及基于该信号途径新型分子靶向药物的设计提供了理论基础。
  • 【期刊】 CDC25B与CDK2/Cyclin A蛋白相互作用研究

    刊名:天津医科大学学报 作者:陈秀博 ; 晋文燕 ; 吴晓辉 ; 马英 关键词:CDC25B ; CDK2/Cyclin A ; 蛋白-蛋白对接 ; 关键氨基酸 机构:天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室 ; 天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室 年份:2018
    摘要:目的:研究双特异性蛋白磷酸酶B(CDC25B)与细胞周期素A(Cyclin A)和细胞周期素依赖性激酶2(CDK2)蛋白发生相互作用的结构基础。方法:应用Discovery Studio(DS)v3.5中的ZDOCK模块对CDC25B与CDK2/Cyclin A蛋白进行对接。应用"Analyze Protein Interface"模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白的溶剂可及表面积(SAS)并分析CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面的关键氨基酸残基。应用"Calculate Interaction Energy"模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面处的关键氨基酸残基间的相互作用能。结果:对pose 1的疏水相互作用、氢键相互作用、相互作用能进行计算分析,预测得到CDC25B-CDK2/Cyclin A复合物的结合模式及起相互作用的氨基酸残基(CDC25B:GLY380,TYR382,ARG485,ARG488,GLU489,ARG490,ARG492,TYR497;CDK2/Cyclin A:THR165,TRP167,ASP206,SER207,ASP210,PHE213)。结论:该结果为今后深入研究CDC25B通路和发挥协同刺激作用的信号体系以及基于该信号途径新型分子靶向药物的设计提供了理论基础。
  • 【期刊】 卵转铁蛋白和卵白蛋白相互作用研究  

    刊名:《食品工业》 作者:金永国 ; 郑彩燕 ; 马美湖 关键词:卵白蛋白 ; 卵转铁蛋白 ; 相互作用 ; 转铁活性 机构:华中农业大学食品科技学院国家蛋品加工技术研发分中心 ; 华中农业大学食品科技学院国家蛋品加工技术研发分中心 年份:2016
    摘要:卵转铁蛋白是蛋清中主要的抗菌蛋白质之一,卵白蛋白在蛋清中的含量也高达56%,在储藏过程中卵白蛋白可能会与卵转铁蛋白发生相互作用,进而影响鸡蛋的品质。研究采用一系列方法对卵白蛋白和卵转铁蛋白之间相互作用现象、动力学参数以及互作对卵转铁蛋白的功能性质进行了研究。循环伏安法以及双偏振极化干涉的方法初步鉴定了二者之间相互作用的存在,并推断其作用模式为嵌合式,表面等离子共振测定相互作用参数KA/KD值分别为152×10^-3和6.59×10^-3,同时对相互作用后卵转铁蛋白的转铁性质进行测定,得到相互作用对卵转铁蛋白的转铁活性有一定的影响。
  • 【期刊】 生物质谱在蛋白-蛋白相互作用研究中的应用

    刊名:生命的化学 作者:吴梅 ; 刘小云 关键词:生物质谱 ; 蛋白-蛋白相互作用 ; 直接鉴定和间接鉴定 机构:北京大学化学与分子工程学院分析化学研究所和合成与功能生物分子中心 ; 北京大学化学与分子工程学院分析化学研究所和合成与功能生物分子中心 年份:2017
    摘要:生物体中的蛋白质通常是通过与其它蛋白质相互作用来发挥功能,因此研究蛋白-蛋白相互作用对于阐明蛋白质的分子作用机理乃至细胞的生命过程具有重要意义。目前研究蛋白-蛋白相互作用的手段有多种,近年随着生物质谱技术的飞速发展,以质谱为工具来研究蛋白质相互作用的方法得到越来越广泛的应用。本文主要介绍利用质谱技术来研究蛋白质相互作用的方法,总结前人的一些研究成果并进行展望。
  • 【期刊】 蛋白-蛋白相互作用:抗肿瘤药物研发的新方向

    刊名:中国新药杂志 作者:蒋永麟 ; 姜正羽 ; 尤启冬 关键词:蛋白-蛋白相互作用 ; 抗肿瘤 ; 小分子药物 机构:中国药科大学江苏省药物分子设计与成药性优化重点实验室 ; 中国药科大学江苏省药物分子设计与成药性优化重点实验室 ; 中国药科大学药物化学教研室 年份:2017
    摘要:肿瘤基因组学、靶向治疗和肿瘤生物学的研究进展明确了蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)在肿瘤发生发展中起着重要的作用,为抗肿瘤药物的研发提供了一个新的方向。然而,基于PPI的小分子药物研发面临着作用界面较大、结合口袋较浅等问题,使得基于PPI的药物开发极具挑战。近年来,PPI"热区"概念的提出,为基于PPI的小分子抑制剂的开发带来了新的思路。拟肽设计、片段筛选等药物发现策略的综合应用,丰富了PPI抑制剂开发的技术手段。由靶标验证(基于基因组学)、药物设计(基于PPI热区)以及临床研究(基于患者基因亚群)构成的三位一体开发模式逐步成形。可以预见,基于PPI的药物研发,将进一步促进肿瘤个体化医疗的发展。本文系统介绍了基于PPI发现抗肿瘤药物的方法,并对MDM2/p53,IAP,Bcl-2等热门靶标进行简要小结。
  • 【期刊】 植物蛋白相互作用的研究方法

    刊名:贵州农业科学 作者:周峰 关键词:植物蛋白 ; 相互作用 ; 分裂泛素化 ; 酵母双杂交 ; 蛋白质芯片 机构:南京晓庄学院生物化工与环境工程学院 ; 南京晓庄学院生物化工与环境工程学院 年份:2014
    摘要:蛋白的相互作用是生命科学研究中的一个重要领域,对于研究未知蛋白的功能与作用具有重要意义,是目前研究的热点领域。文章介绍了非目标蛋白及目标蛋白相互作用的研究方法,讨论了这些研究方法在植物蛋白相互作用上的应用,并展望了研究蛋白相互作用的前景。
  • 【期刊】 辣椒PAP3和PPI蛋白相互作用的鉴定

    刊名:园艺学报 作者:马宁 ; 刘辰 ; 王茹芳 ; 沈火林 关键词:辣椒 ; PAP3 ; PPI ; MADS-box家族 ; 酵母双杂交 ; 体外GST-Pull down 机构:中国农业大学园艺学院设施蔬菜生长发育调控北京市重点实验室 ; 中国农业大学园艺学院设施蔬菜生长发育调控北京市重点实验室 年份:2016
    摘要:PAP3(Gen Bank登录号:HM104635)和PPI(Gen Bank登录号:GU812176)基因是控制辣椒花器官发育的B类基因,共同控制花瓣和雄蕊的发育,均属于MADS-box家族基因。为验证PAP3蛋白和PPI蛋白相互作用,利用酵母双杂交系统,构建pGBKT7-PPI和pGADT7-PAP3酵母表达载体,转化相应酵母AH109感受态细胞后未出现自激活和毒性现象,融合的二倍体酵母(pGBKT7-PPI×pGADT7-PAP3)能在营养缺陷型培养基上生长;同时利用体外GST-Pull down技术,将诱导的GST-PAP3蛋白和His-PPI蛋白孵育,结果均表明,PAP3蛋白和PPI蛋白之间存在特异性相互作用
  • 【期刊】 PAMAM和Amyloid蛋白相互作用的计算模拟

    刊名:生物技术世界 作者:王宛 ; 陈素玲 关键词:树枝形分子 ; Amyloid蛋白 ; 分子模拟 ; 平均力势 ; 径向分布函数 ; p ; H响应 年份:2015
    摘要:采用粗粒化的分子动力学模拟研究了Amyloid蛋白对树枝形分子(PAMAM)的影响,计算了在酸性和中性两种不同p H下,PAMAM分子与Amyloid蛋白不同距离下的回旋半径,形状因子以及径向分布函数.经分析发现Amyloid蛋白对PAMAM分子有较大影响,但树枝形分子内部空间不足以包裹Amyloid蛋白分子.自由能计算结果表明酸性p H条件下PAMAM分子无法吸附到Amyloid蛋白分子表面,而中性条件下二者却能形成稳定复合结构。
  • 【期刊】 辣椒PAP3和PPI蛋白相互作用的鉴定

    刊名:中国园艺文摘 关键词:蛋白相互作用 PAP3 辣椒 PPI 花器官发育 鉴定 家族基因 Bank 年份:2017
    摘要:PAP3(Gen Bank登录号:HM104635)和PPI(GenBank登录号:GU812176)基因是控制辣椒花器官发育的B类基因,共同控制花瓣和雄蕊的发育,均属于MADS—box家族基因。
  • 【期刊】 BCBP与牛血清白蛋白相互作用热力学

    刊名:物理化学学报 作者:郭清莲[1] ; 何欢[2] ; 潘凌立[3] ; 刘义[2] 关键词:塞来昔布衍生物 牛血清白蛋白 相互作用 热力学参数 机构:武汉大学中南医院检验科 ; 武汉大学中南医院检验科 年份:2016
    摘要:塞来昔布衍生物是一类应用非常广泛的治疗急慢性炎症的新型非甾体抗炎药。本文综合利用荧光光谱、紫外吸收光谱、圆二色谱和分子模拟等方法,研究了塞来昔布衍生物1-苯磺酰胺-3-羧基-5-苯基吡唑(BCBP)与牛血清白蛋白(BSA)相互作用的热力学行为。荧光光谱和紫外吸收光谱的分析表明:BCBP能有效猝灭BSA的内源荧光,猝灭机制为静态猝灭。通过所获取的相互作用热力学参数,可知两者之间的相互作用是一个吉布斯自由能降低的自发过程,且二者之间的主要作用力为氢键和范德华力。圆二色谱的分析发现BCBP引起BSA的构象发生改变,其α-螺旋含量降低,无规卷曲含量升高。分子对接的结果与实验结果相符。