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  • 【期刊】 绵羊繁殖调控的转录组学和蛋白组学研究进展

    刊名:中国草食动物科学 作者:王娟红[1,2] ; 臧明[3] ; 郑毛亮[1,2] ; 常卫华[1,2] 关键词:绵羊 ; 繁殖调控 ; 转录组学 ; 蛋白组学 机构:[1]塔里木大学动物科学学院 ; [1]塔里木大学动物科学学院 ; [2]塔里木兵团畜牧科技重点实验室 ; [3]河南省武陟县动物卫生监督所 年份:2018
    摘要:繁殖性状是绵羊重要的经济性状之一,在绵羊生产中具有显著的经济学意义。随着现代分子生物技术的发展,从基因、蛋白水平研究其调控机理已成为当前该领域的研究热点。文章综述了转录组学和蛋白组学及二者关联分析在绵羊繁殖调控上的应用,并对其应用进行了展望。
  • 【期刊】 冠心病血瘀证的代谢组学及蛋白质组学研究进展

    刊名:云南中医学院学报 作者:黄小珊 ; 唐汉庆 ; 黄岑汉 ; 刘燕平 ; 冯悦 ; 庞路路 ; 宁晚玲 ; 张世田 关键词:冠心病 ; 心肌缺血 ; 代谢组学 ; 蛋白质组学 ; @@ 机构:广西中医药大学 ; 广西中医药大学 ; 右江民族医学院 年份:2016
    摘要:冠心病是威胁人类健康的一种心血管疾病.古代中医文献并没有冠心病的病名,目前认为冠心病心绞痛、心肌梗死属中医学厥心痛、真心痛、卒心痛等范畴.中医认为本病与痰浊、瘀血等病理产物阻滞心脉有关,因此血瘀证是冠心病重要的中医证候.近年来,医学家们为进一步了解冠心病血瘀证的发病及证候演变机制,利用代谢组学技术和蛋白质组学技术,从代谢产物和蛋白质差异揭示冠心病血瘀证的证候本质,揭示活血化瘀中药的作用靶点,为今后新药物研发提供依据,为冠心病血瘀证基础研究提供参考.
  • 【期刊】 铜胁迫下小麦幼根转录组学及蛋白质组学研究

    刊名:河南农业科学 作者:张黛静 ; 王多多 ; 董文 ; 马建辉 ; 杨淑芳 ; 张志娟 ; 李春喜 关键词:小麦幼根 ; 铜胁迫 ; 转录组 ; 蛋白组 ; 差异表达 机构:河南师范大学生命科学学院 ; 河南师范大学生命科学学院 年份:2015
    摘要:为探讨外源铜胁迫对小麦幼根的影响,采用水培方法,测定0~60 mg/L不同质量浓度铜处理下小麦幼苗生长发育、转录组表达和蛋白质组表达的差异,探索其抵御重金属毒害的分子机制。结果表明:高质量浓度的铜影响小麦生长,随胁迫时间的延长,小麦幼苗萎蔫发黄,幼根生长受抑。小麦幼根转录组测序检测,共得到2 283个差异表达基因(DEGs),其中826个DEGs表达上调,1 457个DEGs表达下调;将DEGs进行KEGG pathway注释,被注释到31个代谢途径中。双向电泳试验检测,小麦幼根中有2 049个蛋白质点,30 mg/L铜处理96 h后,与对照(0 mg/L处理)相比,约130个蛋白质点表达出现显著差异,其中56个丰度增加,74个丰度降低;质谱鉴定部分差异表达蛋白,抗性蛋白如谷胱甘肽转移酶、27K蛋白等在胁迫下表达上升,而生理代谢相关蛋白表达降低。
  • 【期刊】 质谱技术在蛋白质组学和代谢组学中的研究应用

    刊名:继续医学教育 作者:张文亮 关键词:质谱分析 ; 蛋白质组学 ; 代谢组学 ; 应用 机构:天津市安定医院 ; 天津市安定医院 年份:2014
    摘要:对质谱分析技术、仪器组成、进样方式、离子化方式等进行综述,主要叙述质谱技术在蛋白质组学和代谢组学研究方面的应用,结合其研究领域的最新进展,阐明观点,认为质谱技术发展的过程中,虽然发现了很多标志物,但从实验室向临床诊断转化还有很多工作,需要在不同人群、大规模、多中心的临床试验中来证实其诊断敏感度和特异度,并与常规诊断方法比较。
  • 【期刊】 狼疮肾炎蛋白质组学和代谢组学的研究进展

    刊名:东南大学学报:医学版 作者:李鞠[1,2] ; 谈文峰[1] ; 孟德钎[2] ; 唐凤英[3] ; 张缪佳[1] 关键词:狼疮肾炎 蛋白质组学 代谢组学 标志物 综述 机构:南京医科大学第一附属医院风湿免疫科 ; 南京医科大学第一附属医院风湿免疫科 ; 南京医科大学附属淮安第一医院风湿免疫科 年份:2016
    摘要:狼疮肾炎(LN)是系统性红斑狼疮(SLE)最严重的表现之一,肾脏损害的严重程度与SLE的预后密切相关。LN发病涉及到多种因素,包括遗传易感性、表观遗传调控和环境。近十来年基于组学的技术(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)已广泛地用于SLE及LN生物标志物筛选和疾病的分型分类。这些研究深化了我们对疾病分子基础的认识,对识别潜在治疗靶点、疾病的早期预测及治疗非常重要。本文作者就最近几年狼疮肾炎蛋白质组学及代谢组学的相关研究进展作一综述。
  • 【期刊】 基于文献挖掘视角的组学研究脉络梳理

    刊名:中华医学图书情报杂志 作者:李靖宇 ; 程景民 ; 贺培凤 ; 田玥 ; 于琦 关键词:组学 ; 文献挖掘 ; 共现分析 ; 可视化 机构:山西医科大学管理学院 ; 山西医科大学管理学院 年份:2018
    摘要:目的:梳理组学研究脉络,分析组学研究热点趋势,帮助科研工作者把握研究方向,为科研管理部门在组学研究方面的资助提供决策支持.方法:利用E-utilities下载1986-2016年PubMed数据库收录的含有"-Omics/Omic/Omes/Ome"的题录信息27040819条,在题录信息的题目和摘要中对以"-Omics/Omic/Omes/Ome"结尾的词进行标注、筛选,并利用词频分析法、共现分析法、社会网络分析法对筛选结果进行分析.结果:获得组学相关记录共346977条,文献发表量逐年递增,自2000年后呈井喷式增长.各类单一组学的文献发表量均呈逐年递增的趋势,其中基因组学文献发表量最多.2014年之后,转录组学的文献发表量赶超了蛋白质组学,成为继基因组学之后的第二大组学类型.转录组学、线粒体基因组学与基因组学共现的文献量在某一时间节点后呈井喷式增长,其余组学类型与基因组学共现的文献量都稳定增长.结论:后基因组时代把组学研究推向了高潮,无论是数量还是种类都出现了井喷式的增长.多类型组学的融合研究越来越受科研人员的关注.
  • 【期刊】 基于跨组学技术的育种示踪研究

    刊名:天津农学院学报 作者:程萌杰 ; 施利利 ; 孙宁 ; 张欣 ; 丁得亮 ; 崔晶 ; 边嘉宾 ; 王松文 关键词:水稻 ; 跨组学 ; 育种示踪 机构:天津农学院农学与资源环境学院 ; 天津农学院农学与资源环境学院 ; 天津中日水稻品质食味研究中心 年份:2019
    摘要:水稻育种由经验育种向精确育种转变。在此过程中,适于现代育种的需要,由品种溯源示踪及按照育种路线图进行现代新品种创造,两种示踪技术逐渐发展起来。采用跨组学技术,包括基因组、转录组、蛋白组、代谢组、表型组等,结合常规育种技术、品种亲本溯源,开展了基于跨组学技术的育种示踪研究;结合‘津稻294’‘津原89’等新品种的选育示踪,发展了"骨干品种溯源、优化品种设计、综合技术运用"的育种策略,通过育种实践验证,证明新时期育种可以实现育种的定向性和快周期性。
  • 【期刊】 道地药材品质形成机制的组学研究思路

    刊名:中国中药杂志 作者:王程成 ; 赵慧 ; 严颖 ; 石婧婧 ; 陈舒妤 ; 谈梦霞 ; 陈佳丽 ; 刘子修 ; 陈翠花 ; 邹立思 ; 刘训红 关键词:组学 ; 道地药材 ; 品质形成 ; 基因遗传 ; 生物合成途径 机构:南京中医药大学药学院 ; 南京中医药大学药学院 年份:2018
    摘要:道地药材一直是中药材的"品质标杆",地位不可撼动。道地药材的品质形成从分子层面的基因遗传到最终产物的代谢表型都有涉及,其次生代谢产物的生物合成途径至今并未完全阐明。近年来,不断丰富的组学技术在揭秘复杂生物系统如何运作上功不可没,也同样适用于道地药材复杂的品质形成机制探索。为了缓解道地资源日益匮乏的现状,科学地指导优质品种的移栽,该文综述了组学在解读道地药材从基因到表型的变化过程、次生代谢产物的生物合成途径、与人体的相互作用和品质评价的新方法这些方面的研究成果,为更好地保护和利用中医药资源提供思路。
  • 【期刊】 基于文献挖掘视角的组学研究脉络梳理

    刊名:中华医学图书情报杂志 作者:李靖宇 ; 程景民 ; 贺培凤 ; 田玥 ; 于琦 关键词:组学 ; 文献挖掘 ; 共现分析 ; 可视化 机构:山西医科大学管理学院 ; 山西医科大学管理学院 年份:2018
    摘要:目的:梳理组学研究脉络,分析组学研究热点趋势,帮助科研工作者把握研究方向,为科研管理部门在组学研究方面的资助提供决策支持。方法:利用E-utilities下载1986-2016年Pub Med数据库收录的含有"-Omics/Omic/Omes/Ome"的题录信息27 040 819条,在题录信息的题目和摘要中对以"-Omics/Omic/Omes/Ome"结尾的词进行标注、筛选,并利用词频分析法、共现分析法、社会网络分析法对筛选结果进行分析。结果:获得组学相关记录共346 977条,文献发表量逐年递增,自2000年后呈井喷式增长。各类单一组学的文献发表量均呈逐年递增的趋势,其中基因组学文献发表量最多。2014年之后,转录组学的文献发表量赶超了蛋白质组学,成为继基因组学之后的第二大组学类型。转录组学、线粒体基因组学与基因组学共现的文献量在某一时间节点后呈井喷式增长,其余组学类型与基因组学共现的文献量都稳定增长。结论:后基因组时代把组学研究推向了高潮,无论是数量还是种类都出现了井喷式的增长。多类型组学的融合研究越来越受科研人员的关注。
  • 【论文】 鳜鱼快慢肌蛋白组学与miRNA组学比较分析

    作者:张方亮 关键词:鳜鱼 ; SmyD1a ; SmyD1b ; miR-103 ; miR-144 ; MyomiRNAs ; 调控网络 机构:广西师范大学 ; 广西师范大学 年份:2018
    摘要:鱼肉已成为人们日常摄入肉类蛋白质的重要来源之一,水产养殖业在我国农业中的地位也日益升高。鳜鱼(Siniperca chuatsi)的骨骼肌构成了其鱼体主要的组成部分,可分为快肌纤维和慢肌纤维,两种不同类型的肌纤维在其生理特征及代谢方式等各个方面都存在着极大的不同。鱼类肌肉纤维的不同性状和类型是影响鱼肉品质的重要因素之一,鳜鱼优良的肉质特性与其不同骨骼肌纤维所具有的独特性质是密切相关的。为全面了解鳜鱼的不同类型骨骼肌纤维的性状和特质,我们通过结合蛋白组学和miRNA组学,综合分析比较了快肌与慢肌中差异表达的蛋白质、miRNAs及其相关通路,以期为进一步开展鱼类肌肉生长发育相关研究提供理论依据。研究结果如下:1.鳜鱼快、慢肌蛋白组分析。为了深入了解快、慢肌之间的蛋白差异,采用基于i TRAQ的定量蛋白质组学方法来分析快肌肌肉和慢肌纤维中的蛋白质组差异,总共产生了328763个光谱,鉴定出9711肽段和2102不同的蛋白。其中,有499个蛋白在鳜鱼快、慢肌中呈差异表达,且快肌与慢肌相比有99种蛋白质是差异表达上调,400种蛋白差异表达下调(倍数比值≥1.2或≤0.83,Q值≤0.05)。在这些差异表达的蛋白质中,筛选出了24个与肌纤维性状相关的蛋白质,并分别对所有鉴定出来的蛋白和差异表达的蛋白进行了GO,COG和KEGG pathway分析。2.鳜鱼快、慢肌miRNAs表达谱分析。通过芯片数据分析发现,有59种miRNAs在快、慢肌中的表达呈显著差异(p<0.05),慢肌与快肌相比,发现有32个miRNA显著上调和27个显著下调。其中快肌中高丰度表达的miRNAs有7个,慢肌中有4个。并筛选出19个与肌肉相关的miRNAs,又通过SYBR Green q PCR技术对两种类型肌肉组织中miR-103和miR-144的表达水平进行了验证,其结果与基因芯片相一致,miR-103在慢肌中的表达量高,miR-144在快肌中的表达量较高。3.miR103和miR144靶基因预测及验证。我们发现miR-103和miR-144分别能够在Smy D1a和Smy D1b基因中找到预测的靶位点,并通过双荧光素酶实验验证发现Sym D1a和Smy D1b分别是miR-103和miR-144的靶基因。肌肉的维持和功能需要转录调控因子、结构蛋白、分子伴侣和micro RNAs等共同作用。基于已发表的研究结果和我们获得的数据,我们构建了一个预测的调控网络,Smy D1能与其他调节因子、结构蛋白以及快、慢肌纤维形成中功能关键的micro RNA之间的相互作用。其中miR-103和miR-144主要通过分别调控其靶基因Smy D1a和Smy D1b,并进一步作用其下游功能基因Unc45b和Hsp90a1从而达到调控肌肉生长分化的作用,其具体调控机制还有待进一步研究。
  • 【期刊】 牦牛泌乳期垂体组织比较转录组学分析

    刊名:中国畜牧兽医 作者:朱育星 ; 刘俊 ; 艾翳 ; 陈通 ; 邓志和 ; 何世明 ; 吴锦波 ; 兰道亮 关键词:牦牛 ; 垂体组织 ; 转录组 ; 比较分析 ; 分子机制 机构:西南民族大学生命科学与技术学院 ; 西南民族大学生命科学与技术学院 ; 辽宁省动物卫生监督所 ; 西南民族大学青藏高原研究院 ; 阿坝藏族羌族自治州畜牧科学技术研究所 年份:2019
    摘要:试验旨在了解不同产奶量牦牛泌乳期垂体组织间的转录组差异,为进一步阐述牦牛垂体组织调控泌乳的机制提供参考。提取牦牛垂体组织总RNA,并应用RNA-Seq技术对高产奶量牦牛和低产奶量牦牛泌乳期间垂体组织转录组进行高通量测序及分析。结果显示,通过比较分析高产奶量牦牛和低产奶量牦牛垂体组织转录组数据,筛选出114个差异表达基因,其中55个表现为上调,59个表现为下调。进一步功能分析表明,这些差异基因涉及多种GO分类及KEGG通路,其中GO分析显示,差异基因与许多和氨基酸代谢相关的生物学过程存在紧密关联;KEGG通路分析显示,最为富集的是细胞黏附分子通路,且金黄色葡萄球菌感染和利什曼病等大量与免疫或疾病相关的通路也出现显著富集。本研究对比了高产奶量牦牛和低产奶量牦牛泌乳期垂体组织转录组数据,筛选并分析了相关差异表达基因,为提高牦牛产奶量的研究提供新的思路。
  • 【期刊】 转录组学与中医证候研究现状分析

    刊名:中华中医药杂志 作者:吴芊 ; 邱文琪 ; 宋明 ; 刘玥芸 ; 陈家旭 关键词:中医证候 ; 转录组学 ; 肾阳虚证 ; 湿热证 ; 痰湿证 ; 艾滋病 ; 慢性乙型病毒性肝炎 机构:北京中医药大学中医学院 ; 北京中医药大学中医学院 年份:2017
    摘要:中医证候具有时空动态的复杂性,而转录组反映了生物个体在特定器官、组织或某一特定发育、生理阶段细胞中所有基因表达水平,可用于研究中医证候的生物学基础。文章着重分析近几年中医证候转录组学研究的进展,探讨转录组学技术用于中医证候研究的优势、问题及展望。
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