摘要：

摘要：分析了生命复杂性问题的产生及其由来,从复杂性问题研究的角度对系统科学与系统生物学的含义及其相互关系进行了深入的讨论。

摘要： 随着人类基因组测序计划的完成和后基因组时代的到来,国际上基因组、转录组、蛋白质、代谢组乃至表型组工作的相继开展,随着各种类型功能基因组数据的爆炸性增长,信息整合和数据挖掘的重要性显得尤为突出。有人将细胞的基因组、转录和蛋白质组综合起来称为操纵子组(Operomics)来研究功能,正体现了这种认识。 同时,随着研究的深度和复杂性增加,从生物

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摘要：随着人类基因组测序计划的完成和后基因组时代的到来,国际上基因组、转录组、蛋白质、代谢组乃至表型组工作的相继开展、随着各种类型功能基因组数据的

摘要：＂Systems biology＂是近年涌现的新学术领域,是应用多个学科的知识和大数据,用现代计算技术进行综合分析的整合型大科学。但关于其中译我有不同的看法。首先让人注意到的是,这个英文词猛然看起来不合语法,因为英文的定语是不用复数的。我曾向多人求教,未得其解。

摘要：系统生物学方法论的前沿研究由于其全方位和多层次的特点,成为科技哲学领域颇受关注的难点。系统生物学家们先后提出六种进路,即分子生物学方法论、新系统生物学方法论、机械论方法论、定性和因果模型方法论、综合模型方法论和数据与模型融合方法论以解决其方法论问题。尽管它们分别显示出其科学实践和理论意义的优越性,但因其缺点亦饱受诟病,故目前尚无单一主张获得诸方共识。要走出此困境,我们不仅应理清其历史的哲学矛盾根源,还需处理既有生物学现有方法论的融合和进一步探索生命的认识论问题。关于系统生物学哲学方法论前沿困境的思辨对于生物学各分支、系统科学乃至整个科学体系的拓展和延伸具有积极意义。

摘要：XPPAUT具有卓越高效的计算能力与强大的图形表达能力,尤其在分叉分析方面独具优势,在系统生物学的研究中发挥着重要的作用。本文介绍了XPPAUT的基本知识,通过剖析系统生物学中四类典型的运算问题,如:求随机生物系统的数值解、相平面分析、分叉分析和模拟网络模体的信息处理功能,详细说明了XPPAUT在计算及绘图方面的应用。这将有助于读者深入了解XPPAUT的功能,掌握使用XPPAUT分析研究动力系统的方法。研究表明,XPPAUT计算功能强大,易于编程、理解和应用,是系统生物学研究不可缺少的一个工具。

摘要：为促进国内癌症生物信息学前沿领域在科研方面与国际同行之间的交流，推动我国癌症系统生物学前沿领域的研究与开发，由吉林大学长江学者讲座教授、美国佐治亚大学生物化学与分子生物学系徐鹰教授倡议，吉林大学计算机科学与技术学院，白求恩医学部第一临床医学院于2012年7月5-6日在长春市举办了第2届癌症系统生物学国际研讨会（International Workshop on Cancer Systems Biology,ICSB2012）。

摘要：精准医疗是指针对每个病人的遗传特征量体裁衣式地制定医学治疗方案，这是以全基因组测序为基础的，通过分层将个体归入疾病的不同亚组，而后有的放矢地采取预防性或治疗性干预措施。表观遗传学对个体的影响、生物信息学人才的培养、表型资料的作用、生物样本库建设以及医学数据的有效利用等，都是精准医疗研究的发展过程中亟待解决的问题。需要充分重视并运用系统生物学及系统医学的理论和方法，通过整合分析多个维度与多个层次的生命组学的动态变化，从而整体地、精确地认识疾病，提高精准医疗研究的效率，为医学事业和人类健康做出更大贡献。

摘要：种子系统生物学研究具有重要意义,可为分子育种和作物增产奠定基础。通过系统生物学比较了双子叶植物(拟南芥为代表)和单子叶植物(大麦为代表)种子发育程序差异和基因表达特异性。重点介绍了系统生物学通量平衡分析法、相互作用分析法和转录组学分析法在种子研究中的应用和进展,并对双子叶和单子叶植物种子发育过程中的细胞程序性死亡差异进行了概述。

摘要："Systems biology"是近年涌现的新学术领域,是应用多个学科的知识和大数据,用现代计算技术进行综合分析的整合型大科学。但关于其中译我有不同的看法。首先让人注意到的是,这个英文词猛然看起来不合语法,因为英文的定语是不用复数的。我曾向多人求教,未得其解。美国德克萨斯大学的安德森肿瘤中心新成立了"systems biology"系。我再次求教,被告知"systems"的"-s"是必须的,因为不是一个"system",而