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  • 【期刊】 MyoG和c-fos基因多态性及其合并基因型与猪肌纤维性状的关联分析

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 郭云雁 ; 张龙超 ; 颜华 ; 赵克斌 ; 王立贤 ; 刘文忠 ; 郭慧慧 ; 陈来华 关键词: ; 肌纤维 ; MyoG基因 ; c-fos基因 ; PCR-SSCP 机构:山西农业大学动物科技学院 ; 山西农业大学动物科技学院 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 山西省农业科学院畜牧兽医研究所 年份:2013
    摘要:旨在对MyoG和c-fos基因多态性及其合并基因型与猪肌纤维性状的关联性进行分析。本研究以大白猪(180头)和北京黑猪(170头)2个品种共350头猪作为试验动物,利用冰冻切片、H-E及SDH染色等技术对其进行了肌纤维性状的测定,采用PCR-SSCP技术对肌纤维性状候选基因MyoG与c-fos的外显子进行了SNPs检测,并对不同标记基因型与部分肉质性状和肌纤维性状进行关联分析。结果表明:(1)在MyoG基因外显子1上发现1个多态位点(A2512G),检测到3种基因型(AA、AB、BB);在c-fos基因外显子4上发现2个多态位点(G2650A与A2910G),并分别检测到3种基因型(AA、AB、BB);(2)对A2512G和G2650A2个位点进行分析表明,在2个猪种中,提高A2512G座位上等位基因A的频率可减小肌纤维面积与直径,增加肌纤维密度;提高G2650A位点等位基因B的频率可增加肌纤维密度与红肌纤维比例;而A2910G位点的等位基因A和B则分别具有增加肌纤维面积与肌纤维密度的效应;(3)在北京黑猪,有利合并基因型和不利合并基因型个体的各性状(背膘厚除外)间差异均达到了显著或极显著水平(P<0.05或P<0.01);在大白猪,有利合并基因型和不利合并基因型个体间肌纤维直径、密度、面积、红肌纤维比例、白肌纤维比例和眼肌面积间均达到了显著或极显著水平(P<0.05或P<0.01)。以上结果提示,MyoG和c-fos基因单核苷酸多态性及合并基因型对猪肌纤维性状有一定的影响,可以作为影响猪肌纤维性状的候选基因。
  • 【期刊】 影响猪免疫性状的单倍型关联分析

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 罗维真 ; 陈少康 ; 张龙超 ; 颜华 ; 李勇 ; 王立刚 ; 宋欣 ; 马小军 ; 刘欣 ; 李稳 ; 梁晶 ; 赵克斌 ; 王立贤 关键词:免疫性状 ; 单倍型 ; 关联分析 ; 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 三元种业畜牧研究院 ; 北京市畜牧兽医总站 ; 四川农业大学动物医学院 年份:2013
    摘要:旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因。应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因。分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著;8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因。结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究。
  • 【期刊】 猪红细胞生成素受体基因突变与血常规性状关联分析

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 宋欣 ; 曹随忠 ; 张龙超 ; 王立刚 ; 李勇 ; 刘欣 ; 马小军 ; 梁晶 ; 陈少康 ; 罗维真 ; 颜华 ; 赵克斌 ; 王立贤 关键词:血常规性状 ; EPOR基因 ; 免疫性状 ; ; SNP 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 四川农业大学动物医学院 ; 中国农业大学动物科技学院 年份:2012
    摘要:本研究旨在探索红细胞生成素受体基因(EPOR)影响红细胞相关性状的分子机理。对EPOR基因第1内含子和第4内含子突变位点g.705G>T和g.2373C>T,以飞行时间质谱进行个体基因型分型,在构建的大白猪×民猪F2代资源群体内开展其与6种血常规性状(红细胞压积、血红蛋白、平均红细胞血红蛋白量、平均红细胞体积、红细胞计数及红细胞分布宽度)的关联分析。结果表明,第1内含子突变位点g.705G>T未发现与血常规性状显著关联;第4内含子突变位点g.2373C>T群体内只发现2种基因型,其中CT基因型个体的红细胞压积显著高于CC基因型个体(P<0.05),但并未发现与其他性状显著关联。结果显示,EPOR基因突变可显著影响红细胞压积,说明该基因可作为影响红细胞压积的主效候选基因开展深入研究。
  • 【期刊】 利用大白猪X民猪F2资源群体开展瘦肉量全基因组关联研究

    刊名:农业生物技术学报 作者:程笃学 ; 罗维真 ; 张龙超 ; 颜华 ; 李勇 ; 王立刚 ; 宋欣 ; 马小军 ; 陈少康 ; 刘欣 ; 李稳 ; 梁晶 ; 赵克斌 ; 王立贤 关键词:全基因组关联研究 ; 瘦肉量 ; 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 四川农业大学动物医学院 ; 中国农业大学动物科技学院 年份:2012
    摘要:高密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的出现和基因分型技术平台的发展使在猪上开展全基因组关联分析(GWAS)研究成为现实。本研究以大白猪(Susscrofa)x民猪(S.scrofa)F:设计资源群体为研究对象,采用Illumina公司猪SNP60K分型芯片技术,开展胴体瘦肉量(LMW)GWAS研究,寻找与瘦肉量相关的遗传变异。所有F2代个体在达到(240+7)d日龄时进行屠宰测定。对分型后的355头F2个体,采用基于混合模型及回归的快速全基因组关联及基因组控制法(GRAMMAR.GC)方法进行GWAS分析,结果获得14个在染色体水平与瘦肉量性状显著关联的SNP位点(P〈9.63e.06,SSCl;P〈2.37e.05,SSC2;P〈I.56e.05,SSCl4)。其中2个SNP位点ALGA0010777和ALGA0010788分别位于1号染色体上285030256和285276856bp处;10个SNP位点都位于猪2号染色体末端,可能与己发现的瘦肉量基因突变位点IGF2-intron3一G3072A紧密连锁;2个SNP位点ASGA0065444和ASGA0065455位于14号染色体上99627980和100078535bp处。本研究为猪的瘦肉量性状提供了显著关联SNP位点,预测了新的候选基因。初步阐释了中外猪种瘦肉量性状巨大差异的分子机制,为进一步开展分子育种工作提供了基础研究资料。
  • 【期刊】 利用大白猪×民猪F_2资源群体开展瘦肉量全基因组关联研究

    刊名:农业生物技术学报 作者:程笃学 ; 罗维真 ; 张龙超 ; 颜华 ; 李勇 ; 王立刚 ; 宋欣 ; 马小军 ; 陈少康 ; 刘欣 ; 李稳 ; 梁晶 ; 赵克斌 ; 王立贤 关键词:全基因组关联研究 ; 瘦肉量 ; 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 四川农业大学动物医学院 ; 中国农业大学动物科技学院 年份:2012
    摘要:高密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的出现和基因分型技术平台的发展使在猪上开展全基因组关联分析(GWAS)研究成为现实。本研究以大白猪(Sus scrofa)×民猪(S.scrofa)F2设计资源群体为研究对象,采用Illumina公司猪SNP60K分型芯片技术,开展胴体瘦肉量(LMW)GWAS研究,寻找与瘦肉量相关的遗传变异。所有F2代个体在达到(240±7)d日龄时进行屠宰测定。对分型后的355头F2个体,采用基于混合模型及回归的快速全基因组关联及基因组控制法(GRAMMAR-GC)方法进行GWAS分析,结果获得14个在染色体水平与瘦肉量性状显著关联的SNP位点(P<9.63e-06,SSC1;P<2.37e-05,SSC2;P<1.56e-05,SSC14)。其中2个SNP位点ALGA0010777和ALGA0010788分别位于1号染色体上285030256和285276856bp处;10个SNP位点都位于猪2号染色体末端,可能与已发现的瘦肉量基因突变位点IGF2-intron3-G3072A紧密连锁;2个SNP位点ASGA0065444和ASGA0065455位于14号染色体上99627980和100078535bp处。本研究为猪的瘦肉量性状提供了显著关联SNP位点,预测了新的候选基因。初步阐释了中外猪种瘦肉量性状巨大差异的分子机制,为进一步开展分子育种工作提供了基础研究资料。
  • 【期刊】 利用超声波图像活体预测北京黑猪肌内脂肪含量

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 马小军 ; 王立刚 ; 刘欣 ; 宋欣 ; 梁晶 ; 张龙超 ; 颜华 ; 王立贤 ; 陈来华 ; 谢蜀杨 关键词:北京黑猪 ; 肌内脂肪 ; 超声波图像 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 四川农业大学动物医学院 ; 北京世新华盛牧业科技有限公司 年份:2012
    摘要:本研究旨在利用超声波图像来活体预测北京黑猪背最长肌肌内脂肪含量。试验选用382头北京黑猪开展活体测定,性状包括体质量、10~11肋间眼肌面积、背膘厚和眼肌深度,并且采集猪左侧9~13肋之间距离背中线5cm处纵向超声波图像2张,在每张图像10~11肋间选定1个大小为80×80像素的区域作为研究对象,利用图像分析软件(matlab)分别获取了灰度梯度、灰度共生矩阵、小波变换3类图像参数。屠宰后立刻取胴体左侧10~11肋间背最长肌肉样,利用石油醚抽提法测定肌内脂肪含量(IMF)。以实际测定肌内脂肪含量(IMF)为因变量,体质量、背膘厚、眼肌面积、眼肌深度和图像参数为自变量,通过逐步回归分析法建立预测肌内脂肪含量(PIMF)的模型。重新选择112头北京黑猪利用实测肌内脂肪含量与预测肌内脂肪含量的相关分析进行模型验证。回归分析结果表明,有9个自变量达到显著水平(P<0.05),包括背膘厚、眼肌面积和7个图像参数。预测模型的决定次数(R-Square)和均方误差根(Root MSE)分别为0.305 8和0.006 5。相关性分析结果得到皮尔逊积矩相关系数(Pearson Correlation Coefficients)和斯皮尔曼相关系数(Spearman Correlation Coefficients)分别为0.553 4和0.627 2(P<0.000 1)。结果表明,利用超声波图像活体预测猪肌内脂肪含量是一种可行的方法,可为北京黑猪的育种工作提供一个技术基础。
  • 【期刊】 FSHβ亚基基因与繁殖性能及胎盘性状的关联分析

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 陈来华 ; 王立贤 ; 季跃光 ; 颜华 ; 张龙超 ; 王立刚 ; 李勇 关键词:FSHβ亚基基因 ; 多态性 ; 繁殖性状 ; 胎盘效率 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 北京世新华盛牧业科技有限公司 ; 新疆畜牧科学院畜牧科学研究所 年份:2010
    摘要:以117头大白猪为研究对象,以FSHβ亚基基因为候选基因,采用PCR产物直接电泳方法检测FSHβ亚基基因位点的多态性,检出3种基因型,分别为AA、AB和BB基因型。将基因座不同基因型与总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生体质量(BW)和胎盘性状(PT)进行关联分析。结果表明:FSHβ亚基基因在该位点上,就初产母猪而言,AA和AB基因型比BB型个体的TNB分别多3.25和2.37头(P<0.05),AA和AB基因型比BB型个体的NBA分别多3.31和2.49头(P<0.05)。就经产母猪而言,AA和AB基因型比BB型个体的TNB分别多2.71和1.60头(P<0.05),AA和AB基因型比BB型个体的NBA分别多2.95和1.74头(P<0.05)。AA基因型比AB和BB型个体的胎盘效率(PE)分别高16.28%和23.09%(P<0.05)。总体而言,FSHβ亚基基因在该位点的A等位基因对TNB、NBA和PE均表现为正效应。
  • 【期刊】 降低日粮赖氨酸净能比对育肥猪生产性能及肉品质的影响

    刊名:动物营养学报 作者:程笃学 ; 蔡传江 ; 王立贤 ; 赵克斌 ; 车向荣 ; 颜华 ; 乔莉娟 关键词:赖氨酸净能比 ; 生产性能 ; 肉品质 ; 育肥猪 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 山西农业大学动物科技学院 年份:2010
    摘要:本试验旨在研究降低日粮赖氨酸净能比(Lys/NE)对育肥猪生产性能及肉品质的影响。选用140头(30.0±1.6)kg大白猪,按体重相近,性别比例一致原则随机分到5个处理,每个处理4个重复,每个重复7头猪。在30~61kg阶段所有猪饲喂相同日粮,随后的育肥阶段各处理分别饲喂5种处理日粮:对照、低赖氨酸-1、低赖氨酸-2、低蛋白质-1和低蛋白质-2(粗蛋白质水平分别为15.20%、15.02%、15.11%、12.73%和10.10%;Lys/NE分别为0.72、0.58、0.46、0.58和0.46g/MJ)。结果表明,与对照相比,低赖氨酸-1和低赖氨酸-2处理可显著提高育肥猪平均日增重和肌内脂肪含量(P<0.05),但同时降低粗蛋白质水平对平均日增重和肌内脂肪含量没有显著影响(P>0.05)。各处理间日均采食量、料重比、宰前活重、屠宰率、pH1h、pH24h、剪切力和滴水损失差异均不显著(P>0.05)。与对照相比,低赖氨酸-2和低蛋白质-2处理显著降低肉色值(P<0.05)。除低蛋白质-2处理的育肥猪血浆尿素氮含量显著低于对照外(P<0.05),其他各处理间血浆尿素氮含量差异不显著(P>0.05)。与对照相比,低赖氨酸-1和低赖氨酸-2处理的血浆类胰岛素生长因子-Ⅰ含量显著降低(P<0.05),而低蛋白质-1和低蛋白质-2处理的血浆类胰岛素生长因子-Ⅰ含量显著提高(P<0.05)。结果提示,育肥猪日粮Lys/NE由0.72g/MJ降至0.46g/MJ可显著提高猪肉肌内脂肪含量;育肥猪日粮Lys/NE降至0.46g/MJ时,若同时降低日粮蛋白质水平至10.10%,则会降低育肥猪的饲料转化效率。
  • 【期刊】 猪胎盘性状与繁殖性能关系的研究

    刊名:养猪 作者:程笃学 ; 陈来华 ; 王立贤 ; 颜华 ; 季跃光 关键词: ; 胎盘性状 ; 选育 ; 产仔数 ; 相关性 机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 北京世新华盛牧业科技有限公司 ; 新疆畜牧科学院畜牧科学研究所 年份:2009
    摘要:胎盘效率是对猪窝产仔数进行间接选择最主要的性状之一。本研究以60头纯种大白猪为试验群体,在测定其窝产仔数、窝产活仔数、仔猪初生重及各胎盘性状指标的基础上,分析了各胎盘性状之间的相关性,胎盘效率与窝产仔数、窝产活仔数之间的关系。结果表明,胎盘性状与繁殖性能间存在积极的相关性,胎盘效率高,其窝产仔数和窝产活仔数也高。
  • 【期刊】 猪SP-A基因启动子区的克隆与序列分析

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 陈书明 ; 晋大鹏 ; 王立贤 ; 张龙超 ; 颜华 关键词:猪SP-A基因 ; 启动子区 ; 克隆 ; 染色体步移 ; 序列分析 机构:山西农业大学动物科技学院 ; 山西农业大学动物科技学院 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 年份:2009
    摘要:为了探明猪SP-A基因的启动子及其转录调控机制,设计6条特异性引物,采用染色体步移、克隆测序以及序列比对分析,从大白猪基因组中扩增出一段长度为1 033 bp的猪SP-A基因的上游序列(DQ985806),其GC含量约为55%。经过生物信息学分析,确定了其转录起始位点及活性区域;发现在转录起始位点上游-33 bp处存在1个TATA-box,另外还发现了GC-box、CAAT-box、GT-box以及转录起始子;该序列还包含Sp1、TF和NF-κB等转录因子结合位点以及1个特殊重复序列5-′CATCACTGT-3′。上述试验结果表明,所克隆的1 033 bp的DNA序列是大白猪SP-A基因的启动子区序列。
  • 【期刊】 降低北方寒冷季节生长育肥猪日粮蛋白质水平的可行性研究

    刊名:中国畜牧兽医 作者:程笃学 ; 武晶 ; 赵克斌 ; 王立贤 ; 颜华 ; 赵恒寿 ; 蔡传江 ; 刘欣 关键词:粗蛋白质水平 ; 生长育肥猪 ; 猪舍温度 机构:山西农业大学 ; 山西农业大学 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ; 晋城市畜牧兽医局 年份:2009
    摘要:试验选用147头体重约35 kg的健康大白猪随机分为3组,分别饲喂3种日粮,生长期(35~60 kg)和育肥期(60~100 kg)对照组分别饲喂粗蛋白质水平为16.4%和13.9%的玉米-豆粕型日粮;低蛋白质Ⅰ组分别饲喂粗蛋白质水平为15.4%和13.0%日粮;低蛋白质Ⅱ组分别饲喂粗蛋白质水平为14.3%和11.6%日粮。试验猪舍平均温度16℃。试验结果表明,在低于临界温度的猪舍温度环境下,日粮蛋白质水平降低6%,对生长育肥猪的生长性能、饲料转化效率、背膘厚及每千克增重的饲料成本均无差异显著性影响(P>0.05)。因而,在冬季没有供暖的猪舍,考虑到降低日粮蛋白质带来的减少蛋白质饲料消耗、减少有害气体的排放和对环境的有利影响,日粮蛋白质水平降低6%是完全可行的。
  • 【期刊】 亚麻油对育肥猪肉品质及脂肪组织脂肪酸组成的影响

    刊名:畜牧兽医学报 作者:程笃学 ; 蔡传江 ; 车向荣 ; 赵克斌 ; 王立贤 ; 颜华 ; 武晶 关键词:亚麻油 ; 肉品质 ; 脂肪酸组成 ; 肥育猪 机构:山西农业大学动物科技学院动物营养实验室 ; 山西农业大学动物科技学院动物营养实验室 ; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 年份:2009
    摘要:本试验旨在研究饲料添加亚麻油(linseed oil,LO)对育肥猪胴体指标、肉质及脂肪组织脂肪酸组成的影响。选用平均体质量为63 kg左右的健康大白猪84头(其中21头阉公猪),按体质量相近、性别比例一致原则随机分为3组,每组设4个重复,每个重复7头猪(1或2头阉公猪)。3个处理日粮为玉米-豆粕型日粮,分别添加0%、1.5%和3.0%LO,饲养试验时间为50 d。结果显示,与对照组相比,日粮中添加LO对猪胴体和肉品质指标均没有显著影响(P>0.05);日粮中添加LO显著提高皮下脂肪的α-亚麻酸(ALA)(P<0.01)、EPA(P<0.01)、DPA(P<0.05)含量,以及多不饱和脂肪酸(PUFA)(P<0.05)和n-3PUFA(P<0.01)总含量,同时显著降低花生四烯酸(P<0.01)和二十二碳四烯酸(P<0.01)含量,而对n-6PUFA总含量无显著影响(P>0.05)。结果表明,猪不但可以直接沉积α-亚麻酸,而且能将其进行进一步延长和脱饱和;饲料中添加1.5%LO可将猪皮下脂肪n-6 n-3PUFA比值降至4.1 1,接近人类健康饮食推荐水平,而日粮中添加3.0%LO则能降低皮下脂肪n-6 n-3PUFA比值至2.5 1,大大增加了猪脂肪组织的保健价值。