·
搜索结果:找到“微卫星”相关结果5861条
排序: 按相关 按相关 按时间降序
  • 【期刊】 义乌小鲵微卫星位点的跨种扩增

    刊名:安徽农业科学 作者:刘盼 ; 陈雅琴 ; 邵晨 ; 王宇 关键词:微卫星 ; 义乌小鲵 ; 跨种扩增 ; 多态性 机构:浙江师范大学化学与生命科学学院 ; 浙江师范大学化学与生命科学学院 年份:2018
    摘要:[目的]筛选具有多态性的义乌小鲵(Hynobius yiwuensis)微卫星位点。[方法]采用跨种扩增的方法从安吉小鲵(H.amjiensis)和中国小鲵(H.chinensis)的113个微卫星位点中筛选具有多态性的义乌小鲵微卫星位点。[结果]筛选出11个具有多态性的义乌小鲵微卫星位点。这些多态性微卫星位点的等位基因数为2~6个(平均3.55),观察杂合度为0.200~1.000(平均0.510),期望杂合度为0.500~0.732(平均0.662),多态信息含量为0.375~0.737(平均0.588)。[结论]筛选得到的具有多态性的11个义乌小鲵微卫星位点可应用于其种群遗传学和保护遗传学的研究。
  • 【期刊】 蛋用黑羽鹌鹑微卫星多态性分析

    刊名:中国畜禽种业 作者:庞有志 ; 吴胜军 ; 赵淑娟 ; 白俊艳 ; 张小辉 ; 贠银现 ; 祁艳霞 关键词:微卫星 ; 黑羽鹌鹑 ; 羽色突变 ; 不完全隐性突变 ; 遗传多样性 ; 试验 机构:河南科技大学动物科技学院 ; 河南科技大学动物科技学院 年份:2015
    摘要:对蛋用黑羽鹌鹑群体9个微卫星座位的遗传多态性进行分析,旨在为黑羽鹌鹑遗传资源的评价、保护和利用提供新的依据。结果表明,9个微卫星座位共检测出46个等位基因,平均每个座位检测到5.1111个。平均杂合度为0.6952,平均多态信息含量为0.6204,表明蛋用黑羽鹌鹑是遗传多样性较丰富的群体。其中有8个微卫星可以作为黑羽鹌鹑群体的有效遗传标记进行群体遗传多样性分析。χ2检验表明,9个微卫星座位的基因分布均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。
  • 【期刊】 广西地方鸡微卫星位点LEI0258多态性研究

    刊名:河南农业科学 作者:黄勋和 ; 邓春苗 ; 柯振华 ; 谢洁如 ; 陈洁波 ; 钟福生 关键词:微卫星 ; 广西地方鸡 ; LEI0258 ; 多态性 ; 分子进化 机构:嘉应学院生命科学学院 ; 嘉应学院生命科学学院 年份:2017
    摘要:通过微卫星位点LEI0258基因分型和基因测序,分析6个广西地方鸡品种的遗传变异并构建中介网络图,研究广西地方鸡的遗传多样性与分子进化。结果表明,120份样品经基因分型,检测到38个等位基因,长度为181~507 bp,等位基因205出现的频率最高(0.125),其次是275(0.113)、310(0.100)和251(0.067)。广西地方鸡保持着较高的遗传多样性水平,观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为0.800、0.943和0.936。经测序鉴定出39个等位基因,其中9个为首次发现。11个等位基因与已知的21种血清型相对应。基于侧翼序列变异信息的中介网络图显示,39个等位基因分为3个进化枝,红原鸡的部分基因存在于这些进化枝中,提示红原鸡可能是广西地方鸡的主要祖先。
  • 【期刊】 绿尾虹雉全基因组微卫星分布规律研究

    刊名:四川动物 作者:崔凯 ; 岳碧松 关键词:微卫星 ; 绿尾虹雉 ; 基因组 机构:四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 ; 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 年份:2018
    摘要:分析了绿尾虹雉Lophophorus lhuysii全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行了注释分析。结果显示,在绿尾虹雉1. 01 Gb的全基因组中,1~6个碱基重复类型的完美型微卫星序列共292 430个,总长度5 465 549 bp,相对丰度为290. 47个/Mb,占全基因组的0. 54%,序列长度主要为10~43 bp。不同类型的微卫星中,单碱基重复类型数量最多,长度为3 535 260 bp,占71. 75%,其次是四碱基(611 568 bp,9. 99%)、二碱基(376 944 bp,7. 07%)、三碱基(335 742 bp,6. 38%)、五碱基(500 615 bp,3. 93%)和六碱基(105 420 bp,0. 88%)重复类型。在绿尾虹雉全基因组中,数目最多的10种优势微卫星分别是:A、C、AAAC、AT、AAAT、AC、AAT、AAC、AG、AAAAC,共计占90. 20%,表现出明显A偏倚。分布于外显子的微卫星有2 816个,内含子的有101 791个,基因间区的有187 823个。外显子的微卫星分布于1 314个编码基因中。GO注释分析发现,这些编码基因主要与细胞组分有关,富集前10的条目主要与代谢、转录和合成过程有关。KEGG富集最显著的通路是黏着连接通路。位于外显子的微卫星移码突变可能会造成基因突变,进而可能会影响绿尾虹雉对环境信号的处理。本研究为绿尾虹雉的微卫星筛选和进一步的遗传多样性、功能研究提供了数据基础,从分子角度为绿尾虹雉的保护提供了基础信息。
  • 【期刊】 乌头驴和三粉驴微卫星遗传多态性分析

    刊名:中国畜牧杂志 作者:刘艳艳 ; 谭晴晴 ; 范阳阳 ; 张全芳 ; 盛清凯 ; 贾涛 ; 董书光 ; 步迅 关键词:微卫星 ; 遗传多样性 ; 乌头驴 ; 三粉驴 ; @@ 机构:山东省农业科学院生物技术研究中心 ; 山东省农业科学院生物技术研究中心 ; 山东省农业科学院应用生命科学实验室 ; 胶类中药源性DNA分子鉴定实验室 ; 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 ; 山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室 ; 山东禹城惠民农业科技有限公司 ; 山东省德州黑驴养殖繁育保种基地 ; 山东省农业科学院地方驴品种资源保护科研中心 ; 山东东阿国胶堂阿胶药业有限公司 年份:2017
    摘要:实验旨在了解德州驴中乌头驴和三粉驴2个品系的遗传多态性.利用13个微卫星位点,通过建立多重多色毛细管电泳荧光检测方法,对39头三粉驴和16头乌头驴进行遗传多样性分析,对等位基因数、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度和有效等位基因数进行统计分析.结果表明:13对微卫星位点三粉驴P[C指数平均值为0 47,乌头驴PIC指数平均值为0.40,德州驴2个品系PIC总的平均值为0.47.其中乌头驴品系平均等位基因数为3 31,平均观测杂合度为0.27,有效等位基因数为2.11.三粉驴品系平均等位基因数为4.46,平均观测杂合度为0.33,有效等位基因数为2 61.由此可见,三粉驴比乌头驴的遗传多态性高,但2个驴品系的遗传杂合度均偏低,遗传变异程度较小.
  • 【期刊】 贵妃鸡与麒麟鸡微卫星遗传多样性研究

    刊名:中国畜牧杂志 作者:黄勋和 ; 张金枫 ; 陈洁波 ; 李威娜 ; 钟福生 ; 杜炳旺 关键词:微卫星 ; 多态性 ; 贵妃鸡 ; 麒麟鸡 ; 岭南黄鸡 ; 近交 机构:嘉应学院生命科学学院 ; 嘉应学院生命科学学院 ; 广东海洋大学农学院 年份:2017
    摘要:以岭南黄鸡为参照,利用微卫星位点检测贵妃鸡和麒麟鸡的遗传多样性,评估群体遗传资源现状.结果表明:26个微卫星位点在30个贵妃鸡、40个麒麟鸡和30个岭南黄鸡个体中共检测到197个等位基因,每个位点的等位基因范围为3个(MCW0037、MCW0165、MCW0098)~19个(LEI0234),平均7.58;总体平均期望杂合度为0.6816,平均观察杂合度0.5625,平均多态信息含量0.6327;岭南黄鸡的遗传多样性最高,麒麟鸡次之,贵妃鸡最低;3个群体均偏离了哈迪-温伯格平衡;贵妃鸡和麒麟鸡的群体内近交系数高于岭南黄鸡,表明前者的近亲交配事件较频繁;麒麟鸡群体内的遗传分化系数(均值0.2433)和岭南黄鸡(o.2281)大于贵妃鸡(0.0359),表明后者的有效群体较小.在后续的品种选育工作中应当加强亲本亲缘关系的评估,提高选育群体的有效数量,尽量减少近亲交配.
  • 【期刊】 磁珠富集法分离刀鲚微卫星标记

    刊名:生物技术通报 作者:邓平平 ; 施永海 ; 张根玉 ; 张之文 ; 张海明 ; 陆根海 ; 刘永士 关键词:微卫星 ; 刀鲚 ; 磁珠富集 ; 多态性 机构:上海市水产研究所 ; 上海市水产研究所 年份:2014
    摘要:利用磁珠富集法分离微卫星序列,以开发长江刀鲚微卫星分子标记。将长江刀鲚基因组DNA经限制内切酶Mse I酶切,回收400-1 000 bp片段,安装接头,构建长江刀鲚全基因组PCR文库。用生物素标记的微卫星探针(CA)12与其杂交,磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段。将洗脱所得片段进行PCR扩增,然后进行克隆。经过菌落PCR检验后挑选出118个阳性克隆进行测序,其中97条含有微卫星序列。用设计合成59对微卫星引物对30尾养殖长江刀鲚进行引物的多态性筛选,得到9对多态性引物。
  • 【论文】 长鳍吻鮈微卫星亲子鉴定技术研究

    作者:陈亮 关键词:微卫星 ; 长鳍吻鮈 ; 多重PCR ; 遗传多样性 ; 亲子鉴定 机构:上海海洋大学 ; 上海海洋大学 年份:2017
    摘要:长鳍吻鮈(Rhinogobio ventralis Sauvage et Dabry)主要分布于金沙江、岷江、雅砻江、沱江、乌江下游、嘉陵江中下游以及长江上游干流等流域,是一种习惯于在急流险滩、乱世交错的江河底层等黑暗水环境活动的底栖小型鱼类,属典型的流水性种类。长鳍吻鮈又俗称土耗儿,为我国长江上游特有物种,属于“长江上游珍稀特有鱼类国际级保护区”保护名录中66种特有鱼类之一。近些年来,长江上游各大型梯级水利工程的相继建设,人类过度捕捞与开发利用,长鳍吻鮈种群自然资源量呈急剧下降趋势。从物种价值及其受威胁程度评估发现,长鳍吻鮈已达3级急切保护状,被列为低危鱼类。对此,国内多家增值放流站已将长鳍吻鮈列为增值放流对象,对长鳍吻鮈驯化养殖与人工繁殖技术等方面的研究日益受到重视。本文以长鳍吻鮈为主要研究对象,通过筛选出的多态微卫星位点构建了长鳍吻鮈微卫星荧光多重PCR体系,并将其用于长鳍吻鮈野生亲本种群的遗传特性分析,同时建立了基于微卫星荧光多重PCR的长鳍吻鮈亲子鉴定技术,旨在为长鳍吻鮈人工繁殖、家系管理以及增值放流效果评估等工作提供理论依据和技术支持。其主要研究结果如下:(1)长鳍吻鮈微卫星荧光多重PCR技术的建立与优化从NCBI基因文库中获取了长鳍吻鮈70个微卫星序列,并根据已报道的相应微卫星位点选取33个多态性相对较高的位点合成引物,在12个野生长鳍吻鮈个体中进行PCR扩增,产物经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳以及银染法检测后,挑选出多态性较高、扩增效果最好的15个微卫星位点用以开发多重PCR体系。通过对退火温度以及对反应体系中可能影响多重PCR扩增效果的因素分别进行了优化,本实验最终建立了5组微卫星荧光多重PCR(组合A、B、C、D和E),每组含有3个微卫星位点。(2)基于微卫星标记对长鳍吻鮈泸州野生亲本种群遗传多样性的评估利用长鳍吻鮈15个多态位点及其所构建的微卫星荧光多重PCR技术,对长江上游泸州江段采集的40尾长鳍吻鮈野生亲本群体进行遗传多样性评估以及遗传结构分析。结果共检测到等位基因数为234个,平均等位基因数为15.600,单个位点等位基因数为5(REN02)―23(REN17、RVE-13);多态信息含量为0.729―0.940,平均多态信息含量为0.872;期望杂合度为0.77825―0.95506,平均期望杂合度为0.89600;观测杂合度为0.55263―0.97500,平均观测杂合度为0.82691,表明种群遗传多样性处于较高水平。近交系数为-0.06283―0.29267,平均值为0.07961(P=0.00000±0.00000)。微卫星位点之间未出现显著的连锁不平衡现象。除位点REN16、RV-8、REN34、RVE-13和REN02外,其他位点均显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.05)。利用Structure软件聚类分析表明该长鳍吻鮈种群未出现遗传分化。瓶颈效应检测结果表明该长鳍吻鮈种群个体数量有所下降,近期经历了严重的瓶颈效应。(3)基于微卫星荧光多重PCR的长鳍吻鮈亲子鉴定技术的建立及子一代遗传特征评估利用长鳍吻鮈15个多态位点及其所构建的微卫星荧光多重PCR体系,建立了鳍吻鮈亲子鉴定技术。结果显示,无论亲本基因型是否已知,其累积排除概率均大于99.99%;当仅使用多重PCR组合A、B和C时,在双亲基因型未知和单亲基因型已知的情况下,其累积排除概率分别为99.83%和99.99%,因此可以认定亲本和子代之间存在亲子关系。研究结果表明15个多态微卫星标记所构建的长鳍吻鮈微卫星荧光多重PCR亲子鉴定技术是可靠的。对长鳍吻鮈人工繁殖子一代群体遗传多样性评估结果显示,共检测到的等位基因数为98个,平均等位基因数为6.533,单个位点等位基因数为4―10;多态信息含量为0.579―0.879,平均多态信息含量为0.730;期望杂合度为0.606―0.894,平均期望杂合度为0.766;观测杂合度为0.458―1.000,平均观测杂合度为0.808。表明长鳍吻鮈F1子代群体的遗传多样性较高。F1子代群体总近交系数(FIT)为0.01469,单个群体内近交系数(FIS)为-0.31731;任意两个群体间的遗传分化指数(FST)为0.25203。表明长鳍吻鮈F1子代的整个群体存在一定的近交现象,而单个群体内未出现明显近交现象;3个F1子代群体之间出现了不同程度的遗传分化,遗传距离较远。与长鳍吻鮈野生亲本种群相比,F1子代群体遗传多样性相对较低。
  • 【期刊】 翘嘴鳜F_2家系选育及微卫星亲子鉴定

    刊名:水生生物学报 作者:杨凯 ; 成为为 ; 高银爱 ; 王青云 ; 罗峰 ; 夏儒龙 ; 朱思华 ; 程颖红 ; 邓国乔 关键词:微卫星 ; 翘嘴鳜 ; 亲子鉴定 ; 家系 机构:武汉市水产科学研究所 ; 武汉市水产科学研究所 年份:2015
    摘要:翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)俗称"桂花"、"季花",隶属于鲈形目(Perciformes),鳜属(Siniperca),是鳜属鱼类中体型最大、生长最快的一种~([1])。其肉质坚实细嫩、味道鲜美、营养丰富、无肌间刺,是一种经济价值很高的名贵鱼类,在我国淡水养殖业中占有重要的经济地位~([2])。目前,养殖的翘嘴鳜亲鱼大多从野生资源中捕获而来,缺乏定向选育,加之一些繁育单位不注重亲鱼的保种和留种工作,甚至为了生产上的方便,选择个体小,性成熟早的个
  • 【期刊】 三个远交系豚鼠微卫星遗传结构分析

    刊名:中国比较医学杂志 作者:刘迪文 ; 谭海明 ; 陈雁虹 ; 卫振 关键词:豚鼠 ; 远交系 ; 微卫星标记 ; 遗传多态性 ; 种群差异位点 机构:浙江大学实验动物中心 ; 浙江大学实验动物中心 年份:2018
    摘要:目的评估我校培育的三个远交系豚鼠种群的微卫星遗传结构,筛选不同种群间呈现差异等位基因的微卫星位点,为今后豚鼠遗传育种及应用提供资料。方法使用45对引物通过PCR及电泳技术,对我校三个豚鼠种群的微卫星DNA进行扩增分析,计算各位点等位基因多态性等参数,并筛选出种群间等位基因呈差异变化的微卫星位点。结果所有微卫星位点在豚鼠种群中呈多态性变化,各位点等位基因数2~7不等,平均位点基因数2.29,平均有效基因数1.74;平均期望杂合度为0.39,平均观测杂合度为0.21,多态信息含量的可信范围为0.0739~0.6443,平均PIC为0.32,68.9%的位点呈中度多态性;总Hardy-Weinberg平衡P值平均为0.1734,各种群均为P> 0.05,但对每个位点的基因平衡状态来讲,共有20个位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡,种群平均偏离指数D为-0.407;平均分化指数Fst为0.136,平均基因流Nm为5.835,还阐明了种群间的Nei遗传距离及遗传相似度。结论三个豚鼠种群遗传呈中度多态性变化,种群间平均遗传差异无显著性,遗传相似度较高。群体遗传偏离Hardy-Weinberg平衡较突出,出现严重的近交现象,群体处于中等遗传变异水平,但较高的基因流动阻止了遗传分化发生。分析这些问题的原因,主要是本群体繁殖数量偏小,种子选择范围不广泛等,今后在培育过程中要引起重视。本课题还筛选到与不同种群或毛色豚鼠相关的微卫星位点12个,种群特征性微卫星位点7个,可能用于性状基因定位。
  • 【期刊】 三叶木通微卫星分子标记开发及评价

    刊名:广西植物 作者:李同建 ; 董婧 ; 廖亮 ; 金洪光 ; 韩兴杰 ; 文锋 ; 徐玲玲 关键词:三叶木通 ; 微卫星分子标记 ; 磁珠富集法 机构:九江学院药学与生命科学学院 ; 九江学院药学与生命科学学院 年份:2018
    摘要:为了获得适于三叶木通遗传多样性和遗传结构研究的微卫星分子标记,该研究采用磁珠富集法构建了三叶木通微卫星富集文库。结果表明:在150个阳性克隆中发现了70个微卫星位点,富集效率为46.67%,其中含双碱基重复单元的序列占比为79.37%,三碱基和四碱基重复含有量较少。共设计引物63对,其中筛选出16对高多态引物,对1个三叶木通自然居群48个个体进行了遗传分析,结果显示位点的等位基因数为10~22个,观察杂合度和期望杂合度分别为0.370~0.792和0.724~0.936,多态性信息指数为0.725~0.919,表明以上引物均为高多态性引物。其中,12个位点偏离哈迪-温伯格平衡,呈现出纯合子过剩状态,这可能与哑等位基因和其它因素有关。综上结果表明,该研究所开发的16对引物能够用于三叶木通遗传多样性和遗传结构评价工作。
  • 【期刊】 跨物种筛选黄毛鼠的微卫星分子标记

    刊名:浙江师范大学学报(自然科学版) 作者:韩金巧 ; 谭江东 ; 王艳妮 ; 任鹏 ; 张新玉 ; 龚堃 ; 黄相相 ; 周晓 关键词:黄毛鼠 ; 微卫星标记 ; 跨物种扩增 ; 多态性 机构:浙江师范大学生态研究所 ; 浙江师范大学生态研究所 年份:2017
    摘要:利用微卫星引物侧翼序列具有保守性的特点进行了跨物种筛选黄毛鼠微卫星引物的研究.选取60对大鼠、小鼠已知的微卫星位点引物,对黄毛鼠的基因组DNA进行了PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰氨凝胶电泳及基因扫描技术筛选了适合黄毛鼠的多态性位点引物.研究结果显示,60对微卫星位点引物中,17对引物能够稳定扩增,其中8对引物的多态信息含量(PIC)均大于0.5,为高度多态性引物.研究筛选到的微卫星位点可为后期黄毛鼠的种群遗传学研究提供参考.
上一页 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 下一页 跳转