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  • 【期刊】 植物DNA甲基化与基因表达的关联性研究进展

    刊名:生物技术通报 作者:赵倩 ; 王巍 ; 孙野青 关键词:基因表达 ; 植物 ; DNA甲基化 ; 胁迫环境 机构:大连海事大学环境科学与工程学院环境系统生物学研究所 ; 大连海事大学环境科学与工程学院环境系统生物学研究所 年份:2016
    摘要:DNA甲基化是真核生物基因组最重要的修饰方式之一。就植物DNA甲基化模式、建立、维持机制及其特征进行了综述,并且着重解释了植物DNA甲基化影响基因表达的机制。总结了在胁迫环境下单基因甲基化状态发生改变对于基因表达的影响,并对当前利用高通量测序技术分析植物全基因组范围内DNA甲基化与基因表达的关联分析研究进行综述。
  • 【期刊】 基于基因表达式编程的充填体强度预测模型

    刊名:有色金属:矿山部分 作者:史采星[1] 李永密[2] 郭利杰[1] 陈新[3] 杜向红[4] 关键词:基因表达式编程 充填体强度 充填试验 预测模型 BP神经网络 机构:北京矿冶研究总院 ; 北京矿冶研究总院 年份:2015
    摘要:为准确预测尾砂胶结充填体强度,建立了以孔隙率、粒级不均匀系数、曲率系数、充填料浆浓度、1/灰砂比、养护龄期6个因素作为输入因子,尾砂胶结充填体强度为输出因子的GEP充填体强度预测模型。以多个矿山室内充填物料配比试验数据为例,验证GEP预测模型的可行性。结果表明,GEP预测结果与实际值相对误差仅为5.13%。与BP神经网络模型的预测值进行对比,结果表明,GEP预测模型比BP神经网络模型预测结果(平均相对误差14.09%)更加精确,与实测值的拟合度更好。
  • 【期刊】 基于基因表达式编程的充填体强度预测模型

    刊名:有色金属:矿山部分 作者:史采星[1] 李永密[2] 郭利杰[1] 陈新[3] 杜向红[4] 关键词:基因表达式编程 充填体强度 充填试验 预测模型 BP神经网络 机构:北京矿冶研究总院 ; 北京矿冶研究总院 年份:2015
    摘要:为准确预测尾砂胶结充填体强度,建立了以孔隙率、粒级不均匀系数、曲率系数、充填料浆浓度、1/灰砂比、养护龄期6个因素作为输入因子,尾砂胶结充填体强度为输出因子的GEP充填体强度预测模型。以多个矿山室内充填物料配比试验数据为例,验证GEP预测模型的可行性。结果表明,GEP预测结果与实际值相对误差仅为5.13%。与BP神经网络模型的预测值进行对比,结果表明,GEP预测模型比BP神经网络模型预测结果(平均相对误差14.09%)更加精确,与实测值的拟合度更好。
  • 【期刊】 基于基因表达式编程的充填体强度预测模型

    刊名:《有色金属:矿山部分》 作者:史采星 ; 李永密 ; 郭利杰 ; 陈新 ; 杜向红 关键词:基因表达式编程 ; 充填体强度 ; 充填试验 ; 预测模型 ; BP神经网络 机构:北京矿冶研究总院 ; 北京矿冶研究总院 ; 国家安全生产监督管理总局 ; 中南大学资源与安全工程学院 ; 凡口铅锌矿 年份:2015
    摘要:为准确预测尾砂胶结充填体强度,建立了以孔隙率、粒级不均匀系数、曲率系数、充填料浆浓度、1/灰砂比、养护龄期6个因素作为输入因子,尾砂胶结充填体强度为输出因子的GEP充填体强度预测模型。以多个矿山室内充填物料配比试验数据为例,验证GEP预测模型的可行性。结果表明,GEP预测结果与实际值相对误差仅为5.13%。与BP神经网络模型的预测值进行对比,结果表明,GEP预测模型比BP神经网络模型预测结果(平均相对误差14.09%)更加精确,与实测值的拟合度更好。
  • 【期刊】 基于基因表达谱和生物网络识别肺癌敏感基因

    刊名:国际遗传学杂志 作者:陈传庚 段斌 廖高明 闻懿 常志强 关键词:差异共表达 差异表达 易感基因 机构:哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 ; 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 年份:2015
    摘要:目的解析肺癌敏感基因和基因问异常关系。方法通过比较肺癌样本和对照样本,寻找肺癌细胞中出现的差异表达的基因和差异共表达基因对,将差异表达基因映射到差异共表达网络中,运用网络中节点重要性的度、脆弱性、介数和接近中心性进行排序,筛选肺癌敏感基因。结果共挖掘得到15个具有重要作用的肺癌相关基因,其中有13个基因在肺癌表达谱中存在差异表达。另外,基因CCL19和TNFSF13B虽然不存在表达差异性,但是它们的微小改变能够直接影响着其他基因的显著改变。结论本文在差异表达和共表达研究基础上挖掘得到的新基因对于肺癌机制研究是重要的补充,而且发现了某些基因的微小改变可引起其他基因表达异常,这为进一步了解肺癌发生发展机制奠定了基础。
  • 【期刊】 血瘀证差异基因表达谱的研究进展

    刊名:现代生物医学进展 作者:梁凌飞;翟小虎;李玉文;刘天龙;张一恺;尚沛津;文爱东; 关键词:基因组学;;差异基因表达谱;;血瘀证;;基因芯片技术 机构:空军军医大学西京医院药剂科 ; 空军军医大学西京医院药剂科 年份:2017
    摘要:中医学理论的"证"是中医通过观察病象和整体观思维来认识疾病的独特方式,是中医诊断治疗的基础。"证"在机体病症产生、发展、转化过程中是动态变化的。基因组学的不断发展提供了系统认识"证"本质的可能性。血瘀证是"证"的一大分类,其治疗思路和方法在现代临床心脑血管疾病治疗中应用较广,显示了中医治疗的独特效果。而辨证的不明确始终是对血瘀证认识和治疗的制约因素。利用最新的基因组学理论,特别是应用高通量的基因芯片技术筛选与之相关的关键基因群并以此构建差异基因的表达谱,使血瘀证有了客观科学的定性依据,能够正确诊断和施药治疗。本文就血瘀证的差异基因表达谱的研究进行系统的综述。
  • 【期刊】 基于基因表达谱和生物网络识别肺癌敏感基因

    刊名:国际遗传学杂志 作者:陈传庚 段斌 廖高明 闻懿 常志强 关键词:差异共表达 差异表达 易感基因 机构:哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 ; 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 年份:2015
    摘要:目的解析肺癌敏感基因和基因问异常关系。方法通过比较肺癌样本和对照样本,寻找肺癌细胞中出现的差异表达的基因和差异共表达基因对,将差异表达基因映射到差异共表达网络中,运用网络中节点重要性的度、脆弱性、介数和接近中心性进行排序,筛选肺癌敏感基因。结果共挖掘得到15个具有重要作用的肺癌相关基因,其中有13个基因在肺癌表达谱中存在差异表达。另外,基因CCL19和TNFSF13B虽然不存在表达差异性,但是它们的微小改变能够直接影响着其他基因的显著改变。结论本文在差异表达和共表达研究基础上挖掘得到的新基因对于肺癌机制研究是重要的补充,而且发现了某些基因的微小改变可引起其他基因表达异常,这为进一步了解肺癌发生发展机制奠定了基础。
  • 【期刊】 酵母絮凝基因表达量分析方法的优化

    刊名:中外酒业·啤酒科技 作者:谢鑫 ; 郭立芸 关键词:酵母 ; 絮凝基因 ; 荧光定量PCR ; 基因表达量 机构:北京燕京啤酒股份有限公司技术中心啤酒酿造技术北京市重点实验室 ; 北京燕京啤酒股份有限公司技术中心啤酒酿造技术北京市重点实验室 年份:2018
    摘要:研究以酿酒酵母絮凝基因为研究对象,设计FLO1、FLO5、FLO8、FLO9、FLO10、FLO11、Lg-FLO1及ACT1基因的特异性引物,采用荧光定量PCR为技术手段,通过对反应体系、反应条件的优化,建立了对酵母基因表达量分析的方法。筛选出的8对引物最佳退火温度为55℃,使用优化后的方法对不同酵母菌株絮凝基因表达量进行检测,确定了上面酵母与下面酵母的絮凝基因表达差异,使用荧光定量PCR建立的酵母基因表达量分析方法可以有效针对絮凝基因进行表达量分析。
  • 【期刊】 聚乙烯亚胺促进腺病毒体外基因表达

    刊名:医药导报 作者:颜丹萍 ; 张洪 ; 马频 关键词:聚乙烯亚胺 ; 分子质量,相对 ; 腺病毒 ; 转导效率 机构:武汉大学人民医院药学部 ; 武汉大学人民医院药学部 年份:2017
    摘要:目的 筛选较合适相对分子质量的聚乙烯亚胺(PEI)用于提高腺病毒载体基因表达效率.方法 首先以物理吸附法使PEI与腺病毒相吸附,用噻唑蓝(MTT)法考察PEI-600、PEI-1 800、PEI-25 000复合腺病毒对细胞的毒性;利用体外A549细胞转导实验确定PEI-600、PEI-1 800和PEI-25 000复合腺病毒的最佳剂量比,并对复合物的Zeta电位和粒径分布进行考察分析.结果 MTT实验证明PEI相对分子质量越大,细胞毒性越大,其中PEI-25 000毒性最大;细胞转导试验中,PEI-1 800相对于PEI-600和PEI-25 000更显著促进腺病毒基因在A549细胞中的表达;Zeta电位测定结果显示PEI可以将腺病毒的表面负电荷转变为表面正电荷的粒子.结论 在3种聚合物/腺病毒的复合物中,细胞毒性与聚合物的相对分子质量和浓度呈正相关.相对分子质量越大,浓度越大则聚合物对细胞毒性越大.
  • 【期刊】 火龙果转录组测序、基因表达与功能分析

    刊名:植物科学学报 作者:魏开发 ; 李艺宣 关键词:基因表达 ; 火龙果 ; 转录组测序 ; 生长 ; 花发育 机构:闽南师范大学生物科学与技术学院 ; 闽南师范大学生物科学与技术学院 年份:2019
    摘要:利用高通量测序技术对火龙果(Hylocereus undulatus Britt)红肉品种‘大红二号’的花芽、果实和枝条不同发育阶段的基因表达进行研究。结果显示,转录组测序共获得468.68 Gb原始数据(Raw data),从头组装获得239 152条转录本和162 519条unigene,约53.74%的unigene得到注释。分别在43 506条和16 251条unigene中检测到600 283个SNP位点和56 147个SSR位点。基因表达分析结果表明,在火龙果不同组织Fl510、Fl513、Fl514、Fl518、F711、F715、S513、S419中分别有31、7、5、152、17、63、17、8个特异表达的unigene。通过GO和KEGG富集分析,发现了一些组织特异的GO条目和代谢通路,如在Fl510中富集的类萜骨架生物合成代谢通路等。本研究还对参与花发育的候选基因进行了鉴定和表达分析,他们包括COL基因、FT-like基因、分生组织决定基因和器官决定基因等。
  • 【期刊】 松材线虫侵染对马尾松基因表达的影响

    刊名:森林与环境学报 作者:谢婉凤 ; 梁光红 ; 张飞萍 关键词:基因表达 ; 马尾松 ; 松材线虫 ; 侵染 ; 抗病防御 机构:福建农林大学金山学院 ; 福建农林大学金山学院 ; 福建农林大学林学院 年份:2018
    摘要:病菌侵害影响寄主植物抗性相关基因的表达水平及其系统抗性,松材线虫侵染马尾松后导致其最终枯萎死亡的过程也与基因表达变化有关。为研究该变化,本文检测了松材线虫侵染后的马尾松针叶中信号转导、防御、细胞代谢相关基因的表达情况。结果显示:松材线虫侵染致使马尾松针叶中多个基因表达下调,这些基因包括信号转导相关的钙结合蛋白、类受体蛋白激酶基因,抗病防御相关的烟碱酰胺合成酶、几丁质酶、脱水响应蛋白的编码基因,DNA复制相关的DNA/RNA聚合酶超家族蛋白的编码基因,以及细胞解毒作用相关的细胞色素P450单加氧酶超家族和细胞色素P450基因。由此可见,松材线虫侵染致使马尾松中的信号传递与抗病防御相关的基因表达受到抑制,破坏其系统抗性。
  • 【期刊】 Ajuba对肝糖异生相关基因表达的影响

    刊名:上海交通大学学报:医学版 作者:樊红延[1] 侯照远[2] 董莹[1] 关键词:Ajuba 糖异生 Hep G2 小鼠原代肝细胞 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶 葡萄糖-6-磷酸酶 机构:上海交通大学1.医学院附属仁济医院内分泌科 ; 上海交通大学1.医学院附属仁济医院内分泌科 年份:2015
    摘要:目的观察Lim家族成员Ajuba对糖异生关键基因转录水平的影响,探讨Ajuba参与肝糖代谢调节的分子机制。方法 1慢病毒感染人肝癌细胞系Hep G2,筛选低表达和过表达Ajuba的稳转细胞,通过Western blotting鉴定Ajuba表达情况。2real-time PCR检测Hep G2稳转细胞中糖异生关键酶磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)和葡萄糖-6-磷酸酶(G6P)基因mRNA表达。3分离培养C57BL/6小鼠原代肝细胞并以慢病毒感染法筛选低表达Ajuba的细胞,real-time PCR检测Pepck和G6p mRNA水平。结果 1Western blotting结果显示,低表达和高表达Ajuba的Hep G2细胞均构建成功。2与对照组相比,低表达Ajuba的Hep G2细胞中PEPCK和G6P mRNA水平明显降低,而过表达细胞中则显著升高(P〈0.05)。3低表达Ajuba的小鼠原代肝细胞中Pepck和G6p mRNA水平明显降低(P〈0.05)。结论 Lim蛋白Ajuba能够通过促进肝糖异生关键基因PEPCK和G6P的表达参与糖代谢调节,且该作用不具有种属特异性。
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